RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294304.11

LRP5-201, Transcript of LDL receptor related protein 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP5, Length 5,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5-201ENST00000294304 PGFP49763 221 aa20.19■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 CLCA4Q14CN2 919 aa20.19■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 ANKRD54Q6NXT1 300 aa20.19■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 C20orf27Q9GZN8 174 aa20.19■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 ZNF576Q9H609 170 aa20.19■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 ENPP4Q9Y6X5 453 aa20.19■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 HTR1AP08908 422 aa20.19■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 GSTT2BP0CG30 244 aa20.19■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 CD6P30203 668 aa20.19■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 QSOX2Q6ZRP7 698 aa20.19■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa20.19■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 MED28Q9H204 178 aa20.19■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 LDAHQ9H6V9 325 aa20.19■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 MYNNQ9NPC7 610 aa20.19■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 BMP2P12643 396 aa20.18■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 MACROD1Q9BQ69 325 aa20.18■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 SMOXQ9NWM0 555 aa20.18■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa20.18■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 PGCP20142 388 aa20.18■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 ADAM8P78325 824 aa20.18■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 TMEM225Q6GV28 225 aa20.18■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 FAM86B1Q8N7N1 296 aa20.18■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 CXCL10P02778 98 aa20.18■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 F8A1P23610 371 aa20.18■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 CCINQ13939 588 aa20.18■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 SMCO1Q147U7 214 aa20.18■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 OLFML2AQ68BL7 652 aa20.18■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 GPAT4Q86UL3 456 aa20.18■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 PSD4Q8NDX1 1056 aa20.18■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 ARMC1Q9NVT9 282 aa20.18■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 KLF15Q9UIH9 416 aa20.18■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 GABBR2O75899 941 aa20.18■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 MMP12P39900 470 aa20.18■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa20.18■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 IL22RA1Q8N6P7 574 aa20.18■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 MS4A4EQ96PG1 132 aa20.18■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 ORAI3Q9BRQ5 295 aa20.18■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 B3GNT4Q9C0J1 378 aa20.18■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 CA5BQ9Y2D0 317 aa20.18■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 GABRR3A8MPY1 467 aa20.17■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 F3P13726 295 aa20.17■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 IST1P53990 364 aa20.17■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 TCEAL6Q6IPX3 200 aa20.17■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 ZNF440Q8IYI8 595 aa20.17■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 ZNF675Q8TD23 568 aa20.17■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 CPNE7Q9UBL6 633 aa20.17■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 ZNF221Q9UK13 617 aa20.17■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 ORC5O43913 435 aa20.17■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 TNFRSF1BP20333 461 aa20.17■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 PSMB5P28074 263 aa20.17■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 MC3RP41968 323 aa20.17■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 VEZF1Q14119 521 aa20.17■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 SGTBQ96EQ0 304 aa20.17■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 HSPA12BQ96MM6 686 aa20.17■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 LPAR4Q99677 370 aa20.17■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 PADI2Q9Y2J8 665 aa20.17■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 LAMB2P55268 1798 aa20.17■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 FAM172BPA6NC97 362 aa20.17■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 ANTXRLA6NF34 631 aa20.17■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 PLD2O14939 933 aa20.17■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 PRAMEF2O60811 474 aa20.17■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 CBX5P45973 191 aa20.17■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 ZFP69Q49AA0 526 aa20.17■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 RUNDC3AQ59EK9 446 aa20.17■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 OR9A2Q8NGT5 310 aa20.17■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 OR6N2Q8NGY6 317 aa20.17■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 SLC30A3Q99726 388 aa20.17■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 A0A1W2PPW3 197 aa20.17■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 LSM1O15116 133 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 ACY1Q03154 408 aa20.17■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 TBC1D25Q3MII6 688 aa20.17■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa20.17■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 TTTY10Q9BZA0 68 aa20.17■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa20.16■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 SERTAD2Q14140 314 aa20.16■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 ODF4Q2M2E3 257 aa20.16■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 OR4K5Q8NGD3 323 aa20.16■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 OR6C4Q8NGE1 309 aa20.16■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 EGLN2Q96KS0 407 aa20.16■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 OBP2AQ9NY56 170 aa20.16■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 ERVK-18Q9QC07 812 aa20.16■□□□□ 0.82
LRP5-201ENST00000294304 SEC14L4Q9UDX3 406 aa20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms