RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 IL21RQ9HBE5 538 aa19.23■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 SLC6A20Q9NP91 592 aa19.23■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 VAPAQ9P0L0 249 aa19.23■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP19.23■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa19.23■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 PCDH15Q96QU1 1955 aa19.23■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 A0A1B0GTQ1 180 aa19.22■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 H7BY64 318 aa19.22■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 DSCR3O14972 297 aa19.22■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 YES1P07947 543 aa19.22■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 UGT2B10P36537 528 aa19.22■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 LIPAP38571 399 aa19.22■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 DCTP40126 519 aa19.22■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 PWP1Q13610 501 aa19.22■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 NOXA1Q86UR1 476 aa19.22■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 ESX1Q8N693 406 aa19.22■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 SETD9Q8NE22 299 aa19.22■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 GPR156Q8NFN8 814 aa19.22■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 OR10A6Q8NH74 314 aa19.22■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa19.22■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 CEP76Q8TAP6 659 aa19.22■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 SLC38A4Q969I6 547 aa19.22■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 PRAP1Q96NZ9 151 aa19.22■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 R4GN57 208 aa19.22■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa19.22■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 OR2A25A4D2G3 310 aa19.22■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 M6PRP20645 277 aa19.22■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 CCR8P51685 355 aa19.22■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 SF1Q15637 639 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 TRIM61Q5EBN2 209 aa19.22■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 SPANXN2Q5MJ10 180 aa19.22■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa19.22■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 RABEPKQ7Z6M1 372 aa19.22■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 OR2T12Q8NG77 320 aa19.22■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 ERVK13-1Q9NX77 482 aa19.22■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 ADGRE2Q9UHX3 823 aa19.22■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 MYO15AQ9UKN7 3530 aa19.22■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 FRYLO94915 3013 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 FAM221BA6H8Z2 402 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 B8ZZF3 427 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 SLC28A1O00337 649 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 SLC15A1P46059 708 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 MVKQ03426 396 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 GPR50Q13585 617 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 AP5B1Q2VPB7 878 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 C14orf28Q4W4Y0 310 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 LAS2Q8IYD9 372 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 OR8H2Q8N162 312 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 AVL9Q8NBF6 648 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 OR5K1Q8NHB7 308 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 RNF170Q96K19 258 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 TBCDQ9BTW9 1192 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF318Q5VUA4 2279 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 hCG_2039718K7EN88 272 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 RGS14O43566 566 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 GADD45AP24522 165 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 KIR2DS3Q14952 304 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 OR4K1Q8NGD4 311 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 OMA1Q96E52 524 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 OR2A14Q96R47 310 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 ITPAQ9BY32 194 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 IKZF5Q9H5V7 419 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 ACTR10Q9NZ32 417 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa19.21■□□□□ 0.67
UBE2B-201ENST00000265339 GSAPA4D1B5 854 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 PRR33A8MZF0 331 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 ANKRD28O15084 1053 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 CSNK1G2P78368 415 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 ABATP80404 500 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 REEP5Q00765 189 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 SLC23A3Q6PIS1 610 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 AHSA2Q719I0 299 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 GLRX5Q86SX6 157 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 RAB43Q86YS6 212 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 HUS1BQ8NHY5 278 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 AIF1LQ9BQI0 150 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 BEX2Q9BXY8 128 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 RNF167Q9H6Y7 350 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 GAREM1Q9H706 876 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 ACOXLQ9NUZ1 547 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 MKLN1Q9UL63 735 aa19.2■□□□□ 0.66
UBE2B-201ENST00000265339 RNF6Q9Y252 685 aa19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms