RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 KDELR2P33947 212 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 SHMT2P34897 504 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 PCGF2P35227 344 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 PIK3CBP42338 1070 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 ST13P50502 369 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 NEK2P51955 445 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 YBX1P67809 324 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 CTBSQ01459 385 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 SGCGQ13326 291 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 TMED1Q13445 227 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 DOC2AQ14183 400 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 AMZ1Q400G9 498 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 BCL7AQ4VC05 210 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRC73Q5JTD7 316 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM219BQ5XKK7 198 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 C16orf87Q6PH81 154 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM220Q6QAJ8 160 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 CD163Q86VB7 1156 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 NLRP8Q86W28 1048 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 RASGRP3Q8IV61 690 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 ZZZ3Q8IYH5 903 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC22A15Q8IZD6 547 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 KRT78Q8N1N4 520 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 DEPDC4Q8N2C3 294 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 OR56A3Q8NH54 315 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 CDC26Q8NHZ8 85 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 WDR20Q8TBZ3 569 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 GPBAR1Q8TDU6 330 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 MUL1Q969V5 352 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 AP2M1Q96CW1 435 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 APIPQ96GX9 242 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 TAAR9Q96RI9 348 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 EPYCQ99645 322 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 NUDT22Q9BRQ3 303 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 HDAC8Q9BY41 377 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 ATG10Q9H0Y0 220 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 RIBC2Q9H4K1 309 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 EHD1Q9H4M9 534 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 RUBCNLQ9H714 662 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 SMURF2Q9HAU4 748 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 TPT1P8Q9HAU6 139 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKHQ9HCJ1 492 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 KRT84Q9NSB2 600 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM8A1Q9UBU6 413 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP6V1HQ9UI12 483 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 CD84Q9UIB8 345 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 KCND3Q9UK17 655 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 SVILO95425 2214 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC168Q8NDH2 2452 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC5A10A0PJK1 596 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 A8MVJ9 347 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 ARHGEF33A8MVX0 844 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 M0R3G1 203 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC1A7O00341 560 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 RGS10O43665 173 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 VEGFDO43915 354 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 JRKO75564 520 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 CLPXO76031 633 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 DDAH2O95865 285 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 C9P02748 559 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 GSNP06396 782 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 ANXA8P13928 327 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 CTSEP14091 401 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 EPORP19235 508 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 CXCR2P25025 360 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 ELK4P28324 431 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 PTPN6P29350 595 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 SERPINB1P30740 379 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 CA5AP35218 305 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 GRK3P35626 688 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 HSD17B2P37059 387 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 MMP12P39900 470 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 GSTM5P46439 218 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 PRIM2P49643 509 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 ITGA1P56199 1179 aa6.65□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 IL1RL1Q01638 556 aa6.65□□□□□ -1.34
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