RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ANKRD19PQ9H560 264 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 MED17Q9NVC6 651 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ZNF226Q9NYT6 803 aa8.39□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TRIM64BA6NI03 449 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 J3KTA2 159 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 PDCD5O14737 125 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 PRAMEF10O60809 474 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 WBP4O75554 376 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 SNAPC5O75971 98 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ACP2P11117 423 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 RPS26P62854 115 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 RAE1P78406 368 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 SLC14A1Q13336 389 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 E2F2Q14209 437 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ZNF77Q15935 545 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 FAM214AQ32MH5 1076 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 STEAP3Q658P3 488 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 FAM220AQ7Z4H9 259 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TMC8Q8IU68 726 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 OR2T33Q8NG76 320 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 OR4C6Q8NH72 309 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 SLC38A5Q8WUX1 472 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TM4SF18Q96CE8 201 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 COQ10AQ96MF6 247 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 MCHR1Q99705 422 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 LMAN2LQ9H0V9 348 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 RHBGQ9H310 441 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 SRMSQ9H3Y6 488 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 CXorf36Q9H7Y0 433 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ABCB9Q9NP78 766 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 HMX3A6NHT5 357 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 CENPBD1B2RD01 187 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 SEMG1P04279 462 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 MTNR1AP48039 350 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ATP12AP54707 1039 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 STX4Q12846 297 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ADIPOR2Q86V24 386 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 VWA5B2Q8N398 1253 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 MFSD4AQ8N468 514 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 YIPF4Q9BSR8 244 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 HDAC8Q9BY41 377 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ACTRT3Q9BYD9 372 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 LTB4R2Q9NPC1 389 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ISYNA1Q9NPH2 558 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 BAIAP2Q9UQB8 552 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 HYKKA2RU49 373 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 UNC119BA6NIH7 251 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 SYT5O00445 386 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TRAPPC2P0DI81 140 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TRAPPC2BP0DI82 140 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 CBLP22681 906 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP8.38□□□□□ -1.075e-14■■■■□ 25.9
HERC3-201ENST00000264345 TNFSF8P32971 234 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 IRS1P35568 1242 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 BMPR1AP36894 532 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 FEN1P39748 380 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 SLC19A1P41440 591 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 BTN3A2P78410 334 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 WSCD2Q2TBF2 565 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ZNF385BQ569K4 471 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 PPP2R2DQ66LE6 453 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 RD3Q7Z3Z2 195 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TMEM150AQ86TG1 271 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 CADM3Q8N126 398 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 COX18Q8N8Q8 333 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 CD180Q99467 661 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TIMM29Q9BSF4 260 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 NDC1Q9BTX1 674 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 VN1R3Q9BXE9 311 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 C14orf119Q9NWQ9 140 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TBC1D3EA0A087X179 549 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TBC1D3LB9A6J9 549 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 OR10H2O60403 315 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 CYP17A1P05093 508 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TBC1D3HP0C7X1 549 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 ZNF3P17036 446 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 TGM1P22735 817 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 HMGA2P52926 109 aa8.38□□□□□ -1.07
HERC3-201ENST00000264345 RPS21P63220 83 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
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