RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 CST6Q15828 149 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 TMEM205Q6UW68 189 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 DPPA4Q7L190 304 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 TAS1R3Q7RTX0 852 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 PXKQ7Z7A4 578 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 LAS2Q8IYD9 372 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 NEIL3Q8TAT5 605 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 FBXL20Q96IG2 436 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 PTCHD1Q96NR3 888 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 WACQ9BTA9 647 aa6.89□□□□□ -1.31
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CPS1-201ENST00000233072 SARDHQ9UL12 918 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 KCNS2Q9ULS6 477 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa6.89□□□□□ -1.31
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CPS1-201ENST00000233072 H2AFB2P0C5Z0 115 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 HTR2AP28223 471 aa6.89□□□□□ -1.31
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CPS1-201ENST00000233072 S100A7P31151 101 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 BNIP3Q12983 259 aa6.89□□□□□ -1.31
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CPS1-201ENST00000233072 TMEM135Q86UB9 458 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 ZNF619Q8N2I2 560 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 PCYT2Q99447 389 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
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CPS1-201ENST00000233072 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 VNN3Q9NY84 501 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 TRAPPC13A5PLN9 417 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 A6NCN8 305 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 H7BY64 318 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 SOX14O95416 240 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 IQCF3P0C7M6 154 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 C6P13671 934 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 MYF6P23409 242 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 NTSR1P30989 418 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 GDF5P43026 501 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
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CPS1-201ENST00000233072 SEMG2Q02383 582 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 RIN1Q13671 783 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 MPP7Q5T2T1 576 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 KCTD9Q7L273 389 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 UEVLDQ8IX04 471 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 CPXM2Q8N436 756 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 C16orf78Q8WTQ4 265 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 SPTSSAQ969W0 71 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 PRAP1Q96NZ9 151 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 CASD1Q96PB1 797 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 INPP5EQ9NRR6 644 aa6.89□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
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CPS1-201ENST00000233072 MEGF11A6BM72 1044 aa6.88□□□□□ -1.31
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CPS1-201ENST00000233072 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa6.88□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 I3L521 148 aa6.88□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 LAMTOR5O43504 91 aa6.88□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 DRD1P21728 446 aa6.88□□□□□ -1.31
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CPS1-201ENST00000233072 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 PCGF2P35227 344 aa6.88□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 HLCSP50747 726 aa6.88□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 ART1P52961 327 aa6.88□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 CD83Q01151 205 aa6.88□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 LRP8Q14114 963 aa6.88□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 SFT2D3Q587I9 215 aa6.88□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 PNCKQ6P2M8 343 aa6.88□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 TMEM107Q6UX40 140 aa6.88□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 ZNF852Q6ZMS4 543 aa6.88□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 OR51G2Q8NGK0 314 aa6.88□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 OR9A4Q8NGU2 314 aa6.88□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 PMM1Q92871 262 aa6.88□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 TMEM203Q969S6 136 aa6.88□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 FOLH1BQ9HBA9 442 aa6.88□□□□□ -1.31
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CPS1-201ENST00000233072 EDARQ9UNE0 448 aa6.88□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa6.88□□□□□ -1.31
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CPS1-201ENST00000233072 OR2B3O76000 313 aa6.88□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 CH25HO95992 272 aa6.88□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 RAC2P15153 192 aa6.88□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 CRABP1P29762 137 aa6.88□□□□□ -1.31
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CPS1-201ENST00000233072 PTPRRQ15256 657 aa6.88□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 RAB41Q5JT25 222 aa6.88□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 SLC22A10Q63ZE4 541 aa6.88□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 SUSD1Q6UWL2 747 aa6.88□□□□□ -1.31
CPS1-201ENST00000233072 DNAJC22Q8N4W6 341 aa6.88□□□□□ -1.31
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