RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000056925.15

Col6a3-201, Transcript of Collagen, type VI, alpha 3, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Col6a3, Length 10,106 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Rab35Q6PHN9 201 aa10□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 NfascQ810U3 1240 aa10□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Aoc2Q812C9 757 aa10□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Unc5dQ8K1S2 956 aa10□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Commd9Q8K2Q0 198 aa10□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 GcaQ8VC88 220 aa10□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Olfr1277Q8VF41 303 aa10□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Tsga13Q9DA17 273 aa10□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Hipk2Q9QZR5 1196 aa10□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Btbd35f28A2CFD5 498 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Btbd35f30J3QML3 498 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Pxmp2P42925 194 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Cnn2Q08093 305 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Msi1Q61474 362 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Scgb3a1Q920D7 104 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Cdc20bD3Z3I0 519 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 PigfO09101 219 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Nploc4P60670 608 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 PtnP63089 168 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Ift52Q62559 426 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Ugt2b35Q8BJL9 529 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 PcgF3Q8BTQ0 241 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Pithd1Q8BWR2 211 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Rhbdl1Q8VC82 373 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 AspdhQ9DCQ2 287 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Trip6Q9Z1Y4 480 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Ccdc166S4R181 449 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Scgb1b10A0A087WPW0 93 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Olfr1326-ps1A0A140T8J7 311 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Gm498D3YYH9 372 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Rem1O35929 297 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 BlkP16277 499 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 EdnrbP48302 442 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Bace1P56818 501 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Kcna7Q17ST2 489 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 HlxQ61670 476 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Fbxw21Q8BI38 468 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Clrn1Q8K445 232 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Olfr617Q8VGA1 318 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Olfr347Q8VGK2 312 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Wasf3Q8VHI6 501 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 AspnQ99MQ4 373 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 LipgQ9WVG5 500 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Gm34653A0A1L1SR01 368 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 ShdO88834 343 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 DbpQ60925 325 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Acvrl1Q61288 502 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Brinp2Q6DFY8 783 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Tmem220Q8BP07 167 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Q91W34 466 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 SharpinQ91WA6 380 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 St3gal4Q91Y74 333 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 L2hgdhQ91YP0 464 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Ca7Q9ERQ8 264 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 B3galt5Q9JI67 308 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Mtcl1Q3UHU5 1945 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Hbb-yP02104 147 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 FpgsP48760 587 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Sult2a2P50236 285 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 FapP97321 761 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Gpr150Q8BL07 427 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Nadk2Q8C5H8 452 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Vmn1r203Q8R273 311 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Rdh10Q8VCH7 341 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Tinagl1Q99JR5 466 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Cd302Q9DCG2 228 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Tlr6Q9EPW9 795 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Rhox2dW4VSN9 191 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Dip2bQ3UH60 1574 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Usp17lbE9Q9U0 468 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Tgm3Q08189 693 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Tmem104Q3TB48 496 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Olfr1299Q7TQX5 312 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Mrps10Q80ZK0 160 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Ms4a4cQ9D3F6 226 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Agpat3Q9D517 376 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Olfr27Q9EQ90 311 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Zc3h8Q9JJ48 305 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Gm33543A0A1B0GSI5 81 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Obp1bA2AEP0 171 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Gm14743A2BHD2 171 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Olfr1564K7N6V7 318 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Olfr6P34986 316 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Pax6P63015 422 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Rps5P97461 204 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 BC100530Q497J0 97 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Dnajb13Q80Y75 316 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Zfp799Q8BHK4 648 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 NkrfQ8BY02 690 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Dok4Q99KE3 325 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Moap1Q9ERH6 352 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Jam2Q9JI59 298 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 ShprhQ7TPQ3 1674 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Amd2D3Z6H8 334 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Amd1P0DMN7 334 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Gabrr2P56476 465 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 BidP70444 195 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Col6a2Q02788 1034 aa9.99□□□□□ -0.81
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Mtmr11Q3V1L6 700 aa9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10.1 ms