RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640634.1

SCARB2-222, Transcript of scavenger receptor class B member 2, human

TSL 5

Gene SCARB2, Length 1,734 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCARB2-222	ENST00000640634	MPEG1	Q2M385	716 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SCARB2-222	ENST00000640634	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SCARB2-222	ENST00000640634	BORA	Q6PGQ7	559 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SCARB2-222	ENST00000640634	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SCARB2-222	ENST00000640634	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SCARB2-222	ENST00000640634	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SCARB2-222	ENST00000640634	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SCARB2-222	ENST00000640634	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SCARB2-222	ENST00000640634	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
SCARB2-222	ENST00000640634	THAP4	Q8WY91	577 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SCARB2-222	ENST00000640634	KLHL29	Q96CT2	875 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SCARB2-222	ENST00000640634	CCT7	Q99832	543 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SCARB2-222	ENST00000640634	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SCARB2-222	ENST00000640634	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
SCARB2-222	ENST00000640634	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SCARB2-222	ENST00000640634	MYNN	Q9NPC7	610 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SCARB2-222	ENST00000640634	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SCARB2-222	ENST00000640634	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
SCARB2-222	ENST00000640634	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		10.21	□□□□□ -0.77
SCARB2-222	ENST00000640634	C1orf226	A1L170	272 aa		10.21	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	GPR75	O95800	540 aa		10.21	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	HP	P00738	406 aa		10.21	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	IGHE	P01854	428 aa		10.21	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	CT62	P0C5K7	136 aa		10.21	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	PGD	P52209	483 aa		10.21	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	AQP5	P55064	265 aa		10.21	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	POLE2	P56282	527 aa		10.21	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	SLC26A5	P58743	744 aa		10.21	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	BTBD16	Q32M84	506 aa		10.21	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	COLEC12	Q5KU26	742 aa		10.21	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	BRICD5	Q6PL45	260 aa		10.21	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		10.21	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		10.21	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	EXD3	Q8N9H8	876 aa		10.21	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		10.21	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		10.21	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	TANK	Q92844	425 aa		10.21	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	NUDT9	Q9BW91	350 aa		10.21	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		10.21	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	LHX6	Q9UPM6	363 aa		10.21	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		10.21	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	SAGE2P	A6NJ88	616 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	C17orf105	B2RV13	164 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	DDAH2	O95865	285 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	CPM	P14384	443 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	CD1E	P15812	388 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	DDC	P20711	480 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	ITGA3	P26006	1051 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	RAD52	P43351	418 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	IDH3A	P50213	366 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	XK	P51811	444 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	LY6D	Q14210	128 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	EPGN	Q6UW88	154 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	GALNT16	Q8N428	558 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	PSMF1	Q92530	271 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	TEX37	Q96LM6	180 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	ZNF681	Q96N22	645 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	LPAR4	Q99677	370 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	NPAS2	Q99743	824 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	OR8D2	Q9GZM6	311 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	WDR41	Q9HAD4	459 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634		A0A1B0GVC2	190 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634		E9PBE3	544 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	KLHL41	O60662	606 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	F10	P00742	488 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	PIK3R1	P27986	724 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	ERVK-8	P63133	956 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	EMX2	Q04743	252 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SCARB2-222	ENST00000640634	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		10.19	□□□□□ -0.78

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