RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638939.1

PDE4D-229, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 375 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-229ENST00000638939 DERL2Q9GZP9 239 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-229ENST00000638939 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-229ENST00000638939 ACKR4Q9NPB9 350 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-229ENST00000638939 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-229ENST00000638939 DMRT3Q9NQL9 472 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-229ENST00000638939 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-229ENST00000638939 CNIH4Q9P003 139 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-229ENST00000638939 SPRR3Q9UBC9 169 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-229ENST00000638939 ASIC3Q9UHC3 531 aa5.06□□□□□ -1.6
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PDE4D-229ENST00000638939 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-229ENST00000638939 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-229ENST00000638939 JRKLQ9Y4A0 524 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-229ENST00000638939 SPACA6W5XKT8 324 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-229ENST00000638939 HIVEP2P31629 2446 aa5.06□□□□□ -1.6
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PDE4D-229ENST00000638939 STAB1Q9NY15 2570 aa5.06□□□□□ -1.6
PDE4D-229ENST00000638939 A0A0G2JN53 185 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-229ENST00000638939 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-229ENST00000638939 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-229ENST00000638939 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa5.05□□□□□ -1.6
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PDE4D-229ENST00000638939 PROM1O43490 865 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-229ENST00000638939 DYRK3O43781 588 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-229ENST00000638939 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
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PDE4D-229ENST00000638939 BANF1O75531 89 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-229ENST00000638939 ATP6AP2O75787 350 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-229ENST00000638939 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
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PDE4D-229ENST00000638939 CD247P20963 164 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-229ENST00000638939 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-229ENST00000638939 SERPINB1P30740 379 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-229ENST00000638939 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-229ENST00000638939 TIMP3P35625 211 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-229ENST00000638939 STT3AP46977 705 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-229ENST00000638939 DNASE1L1P49184 302 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-229ENST00000638939 PGGT1BP53609 377 aa5.05□□□□□ -1.6
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PDE4D-229ENST00000638939 STX4Q12846 297 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-229ENST00000638939 BIKQ13323 160 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-229ENST00000638939 LAPTM5Q13571 262 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-229ENST00000638939 ZNF460Q14592 562 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-229ENST00000638939 SLC10A1Q14973 349 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-229ENST00000638939 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-229ENST00000638939 SETDB1Q15047 1291 aa5.05□□□□□ -1.6
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PDE4D-229ENST00000638939 PIGGQ5H8A4 983 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-229ENST00000638939 PAGE2BQ5JRK9 111 aa5.05□□□□□ -1.6
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PDE4D-229ENST00000638939 ZNF597Q96LX8 424 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-229ENST00000638939 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-229ENST00000638939 TBCDQ9BTW9 1192 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-229ENST00000638939 MS4A8Q9BY19 250 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-229ENST00000638939 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-229ENST00000638939 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa5.05□□□□□ -1.6
PDE4D-229ENST00000638939 PRDM14Q9GZV8 571 aa5.05□□□□□ -1.6
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