RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629943.2

PCBP1-AS1-355, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 725 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 NXPH4O95158 308 aa3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 POP4O95707 220 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 PCP11498 1178 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 ANPEPP15144 967 aa3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 AREGP15514 252 aa3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 STIP1P31948 543 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 ATP4BP51164 291 aa3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 NDST2P52849 883 aa3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 TMEM50BP56557 158 aa3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 SRP54P61011 504 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 C2CD6Q53TS8 623 aa3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 CMPK2Q5EBM0 449 aa3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 PLPP4Q5VZY2 271 aa3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 RAB12Q6IQ22 244 aa3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 TRIM65Q6PJ69 517 aa3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 OR4N5Q8IXE1 308 aa3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 SPPL2AQ8TCT8 520 aa3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 RAB3CQ96E17 227 aa3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 ZNF597Q96LX8 424 aa3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 TMEM237Q96Q45 408 aa3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 ATP6V0BQ99437 205 aa3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 SSX3Q99909 188 aa3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 PKP2Q99959 881 aa3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 LRRC61Q9BV99 259 aa3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 WWTR1Q9GZV5 400 aa3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 NDE1Q9NXR1 346 aa3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 CYP39A1Q9NYL5 469 aa3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 MOSPD1Q9UJG1 213 aa3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 ERVK-19Q9WJR5 959 aa3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 USP6P35125 1406 aa3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 RGPD5Q99666 1765 aa3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 MAP3K5Q99683 1374 aa3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 NINLQ9Y2I6 1382 aa3□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 SHANK3Q9BYB0 1731 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 KIF7Q2M1P5 1343 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 QRICH2Q9H0J4 1663 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 MACROD2A1Z1Q3 448 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 ASB14A6NK59 587 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 KPNA7A9QM74 516 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 TNFSF12O43508 249 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 SNAP91O60641 907 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 CXCL14O95715 111 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 SLC4A1P02730 911 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 TRIM49P0CI25 452 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 TRIM49CP0CI26 452 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 KRT3P12035 628 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 UGT1A4P22310 534 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 PKLRP30613 574 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 CAPGP40121 348 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 CASP9P55211 416 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 GSCP56915 257 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 RPL27P61353 136 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 MS4A2Q01362 244 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 NFATC2Q13469 925 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 B3GLCTQ6Y288 498 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 BNIPLQ7Z465 357 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 PARP8Q8N3A8 854 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 CCNYQ8ND76 341 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 OR52E1Q8NGJ3 308 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 OR10G7Q8NGN6 311 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 URGCPQ8TCY9 931 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 GLYATL1Q969I3 302 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 ESAMQ96AP7 390 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 MOCOSQ96EN8 888 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 COG3Q96JB2 828 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 LGMNQ99538 433 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 FAM213AQ9BRX8 229 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 CCM2Q9BSQ5 444 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 GFRA4Q9GZZ7 299 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 ABCG8Q9H221 673 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 CARD9Q9H257 536 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 MARCH7Q9H992 704 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 VIPAS39Q9H9C1 493 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 SLC25A19Q9HC21 320 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 GDF3Q9NR23 364 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 TAS2R16Q9NYV7 291 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 NUDCQ9Y266 331 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 MOB4Q9Y3A3 225 aa2.99□□□□□ -1.93
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 KNSTRNQ9Y448 316 aa2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms