RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 C11orf65Q8NCR3 313 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 KAT2AQ92830 837 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 MAL2Q969L2 176 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 MAGED4Q96JG8 741 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC35G5Q96KT7 338 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 OR1F2PQ96R84 312 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 SERHL2Q9H4I8 314 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 CLDN16Q9Y5I7 305 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 DHRS12A0PJE2 317 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 EFCAB7A8K855 629 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 TGFBR3LH3BV60 316 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 SLITRK5O94991 958 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 TIAF1O95411 115 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 GPIP06744 558 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 UMPSP11172 480 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 FGF5P12034 268 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 FBLP22087 321 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 CCKBRP32239 447 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 PCGF2P35227 344 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 MAGEA8P43361 318 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 DSTNP60981 165 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 RPS26P62854 115 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC34A1Q06495 639 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 ILKQ13418 452 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 C1orf189Q5VU69 101 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 CEACAM20Q6UY09 585 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP1R3BQ86XI6 285 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM126BQ8IUX1 230 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 ADGRG5Q8IZF4 528 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 BMPERQ8N8U9 685 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 OR7G2Q8NG99 324 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 NCLNQ969V3 563 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM162AQ96A26 154 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 LANCL2Q9NS86 450 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-215ENST00000628018 UPK1AO00322 258 aa23.33■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 SCRG1O75711 98 aa23.33■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 IFI6P09912 130 aa23.33■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 IL10P22301 178 aa23.33■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 PRIM2P49643 509 aa23.33■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 BTG2P78543 158 aa23.33■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 IL11RAQ14626 422 aa23.33■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa23.33■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 SZRD1Q7Z422 152 aa23.33■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 NUP43Q8NFH3 380 aa23.33■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF675Q8TD23 568 aa23.33■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 APMAPQ9HDC9 416 aa23.33■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 PTGFRNQ9P2B2 879 aa23.33■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa23.33■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 AP4S1Q9Y587 144 aa23.33■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 JRKO75564 520 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
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CAPNS1-215ENST00000628018 E2F1Q01094 437 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 MGAT2Q10469 447 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 FHL5Q5TD97 284 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 OR2L13Q8N349 312 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC38A9Q8NBW4 561 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 MIPOL1Q8TD10 442 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 YIPF2Q9BWQ6 316 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKRA2Q9H9E1 313 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 TRPC4Q9UBN4 977 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 PRDM4Q9UKN5 801 aa23.32■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 SPEGQ15772 3267 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A087WV62 115 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 HMGN4O00479 90 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 BAG2O95816 211 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 NT5EP21589 574 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 MATN1P21941 496 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
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CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGAP40Q5TG30 622 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM111BQ6SJ93 734 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 CTHRC1Q96CG8 243 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 GIMAP5Q96F15 307 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 OR51I1Q9H343 314 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 OLAHQ9NV23 265 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 ARMC1Q9NVT9 282 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 MAT2BQ9NZL9 334 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 MMACHCQ9Y4U1 282 aa23.31■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-215ENST00000628018 CUL9Q8IWT3 2517 aa23.3■■□□□ 1.32
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