RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	PSMB5	P28074	263 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	NPY2R	P49146	381 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	PRLHR	P49683	370 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	GAS1	P54826	345 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	TPI1	P60174	286 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	TEK	Q02763	1124 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	RPS6KA1	Q15418	735 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	MARC1	Q5VT66	337 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	TRNP1	Q6NT89	227 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	AAGAB	Q6PD74	315 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	IFNE	Q86WN2	208 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	PARP8	Q8N3A8	854 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	NECAB1	Q8N987	351 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	DIO2	Q92813	273 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	EPSTI1	Q96J88	318 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	PINK1	Q9BXM7	581 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	VPS16	Q9H269	839 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	NPHS2	Q9NP85	383 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	NOX4	Q9NPH5	578 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	PNO1	Q9NRX1	252 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	SOX13	Q9UN79	622 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	SPACA6	W5XKT8	324 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440		B9A039	149 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440		H0YHG0	523 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440		J3QW42	95 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	BIN1	O00499	593 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	PF4	P02776	101 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	MYL1	P05976	194 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	FCGR2A	P12318	317 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	KRT5	P13647	590 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	GNA15	P30679	374 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	TXLNA	P40222	546 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	STAT6	P42226	847 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	BTG2	P78543	158 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	ITGA9	Q13797	1035 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	PON3	Q15166	354 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440		Q6YL49	198 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	OR2L3	Q8NG85	312 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	HSPH1	Q92598	858 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	TFAP2C	Q92754	450 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	KAT5	Q92993	513 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	RILP	Q96NA2	401 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	IL17F	Q96PD4	163 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	DPH7	Q9BTV6	452 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	MRI1	Q9BV20	369 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	SYNPO2L	Q9H987	977 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	DNAH2	Q9P225	4427 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		5.35	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC151	A5D8V7	595 aa		5.35	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		5.35	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	GNB5	O14775	395 aa		5.35	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	KLF11	O14901	512 aa		5.35	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	TP73	O15350	636 aa		5.35	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	AVIL	O75366	819 aa		5.35	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	TSPAN9	O75954	239 aa		5.35	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	SNX4	O95219	450 aa		5.35	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	PEX11B	O96011	259 aa		5.35	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	FBXO45	P0C2W1	286 aa		5.35	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	TNNI3	P19429	210 aa		5.35	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	IL11	P20809	199 aa		5.35	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	SERPINF1	P36955	418 aa		5.35	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF83	P51522	516 aa		5.35	□□□□□ -1.55
SNAP23-223	ENST00000627440	NEK2	P51955	445 aa		5.35	□□□□□ -1.55

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