RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 RPS6KA6Q9UK32 745 aa20.33■□□□□ 0.85
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SGMS1-210ENST00000619438 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SGMS1-210ENST00000619438 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SGMS1-210ENST00000619438 SF1Q15637 639 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SGMS1-210ENST00000619438 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
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SGMS1-210ENST00000619438 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SGMS1-210ENST00000619438 NKD1Q969G9 470 aa20.32■□□□□ 0.84
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SGMS1-210ENST00000619438 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
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SGMS1-210ENST00000619438 KIR2DS3Q14952 304 aa20.31■□□□□ 0.84
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SGMS1-210ENST00000619438 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa20.31■□□□□ 0.84
SGMS1-210ENST00000619438 TTC23Q5W5X9 447 aa20.31■□□□□ 0.84
SGMS1-210ENST00000619438 FAM71E1Q6IPT2 247 aa20.31■□□□□ 0.84
SGMS1-210ENST00000619438 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa20.31■□□□□ 0.84
SGMS1-210ENST00000619438 SLC22A18Q96BI1 424 aa20.31■□□□□ 0.84
SGMS1-210ENST00000619438 OR2A14Q96R47 310 aa20.31■□□□□ 0.84
SGMS1-210ENST00000619438 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa20.31■□□□□ 0.84
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SGMS1-210ENST00000619438 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
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SGMS1-210ENST00000619438 CBLL1Q75N03 491 aa20.3■□□□□ 0.84
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SGMS1-210ENST00000619438 OR51B5Q9H339 312 aa20.29■□□□□ 0.84
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SGMS1-210ENST00000619438 CCNYL3P0C7X3 344 aa20.29■□□□□ 0.84
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SGMS1-210ENST00000619438 RGNQ15493 299 aa20.29■□□□□ 0.84
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF385BQ569K4 471 aa20.29■□□□□ 0.84
SGMS1-210ENST00000619438 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa20.29■□□□□ 0.84
SGMS1-210ENST00000619438 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SGMS1-210ENST00000619438 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
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