RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 POPDC3Q9HBV1 291 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 NPAP1Q9NZP6 1156 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1W2PS29 197 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SLC22A31A6NKX4 558 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SCAMP1O15126 338 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 HBE1P02100 147 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 HEXAP06865 529 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ELK4P28324 431 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 GMPRP36959 345 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 MC3RP41968 323 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 GBX1Q14549 363 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM198Q66K66 360 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SLC8B1Q6J4K2 584 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SAMD7Q7Z3H4 446 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SLC51AQ86UW1 340 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SLC5A11Q8WWX8 675 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ADAM29Q9UKF5 820 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1B0GUL6 1792 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1W2PPH5 198 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TGOLN2O43493 480 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 AK1P00568 194 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 KNG1P01042 644 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 AKR1C4P17516 323 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SP3Q02447 781 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PCLAFQ15004 111 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ACTBL2Q562R1 376 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 NAA40Q86UY6 237 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 OR56B4Q8NH76 319 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ARNTL2Q8WYA1 636 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TBX5Q99593 518 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 KLHL9Q9P2J3 617 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 EXTL2Q9UBQ6 330 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 GPR160Q9UJ42 338 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 C4AP0C0L4 1744 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 C4BP0C0L5 1744 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF850A8MQ14 1090 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SYNGR4O95473 234 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CD63P08962 238 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TACR2P21452 398 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 EMC10Q5UCC4 262 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 LIPKQ5VXJ0 399 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 GAL3ST4Q96RP7 486 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SALL4Q9UJQ4 1053 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 C10orf71Q711Q0 1435 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 MUSKO15146 869 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 MSI1O43347 362 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TAS2R46P59540 309 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 NKX3-2P78367 333 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 GHRHRQ02643 423 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 DYRK1AQ13627 763 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 MS4A15Q8N5U1 240 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 NFKBIDQ8NI38 313 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 TXNDC15Q96J42 360 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 COQ10AQ96MF6 247 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 GPR88Q9GZN0 384 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ANKRD34BA5PLL1 514 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PDHXO00330 501 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 MITFO75030 526 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 RFPL3O75679 317 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 NUDT1P36639 197 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ERVK-21P61565 698 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CDNFQ49AH0 187 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 MINDY4Q4G0A6 757 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 NOXRED1Q6NXP6 359 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CD300LGQ6UXG3 332 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PIP5K1AQ99755 562 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 OR11A1Q9GZK7 315 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 AMBNQ9NP70 447 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PRODH2Q9UF12 536 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CDHR4A6H8M9 788 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 A8MT66 165 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SYN3O14994 580 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 KIAA0513O60268 411 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 SCGB1D1O95968 90 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CSF2P04141 144 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 HTR1EP28566 365 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CD97P48960 835 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 RHBDL3P58872 404 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 BATFQ16520 125 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 ANKRD54Q6NXT1 300 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 CHST9Q7L1S5 443 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRT-209ENST00000612229 OR10T2Q8NGX3 314 aa6.7□□□□□ -1.34
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