RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM135Q86UB9 458 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 NRROSQ86YC3 692 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 LRRC49Q8IUZ0 686 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 FOXRED2Q8IWF2 684 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 SPPL2BQ8TCT7 592 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 PPP4R1Q8TF05 950 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 CASP10Q92851 521 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 FBXO32Q969P5 355 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 ORAI1Q96D31 301 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 C5orf30Q96GV9 206 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 CAPNS2Q96L46 248 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 IL12RB2Q99665 862 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 TBL1YQ9BQ87 522 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM175Q9BSA9 504 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 ZYG11BQ9C0D3 744 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 WWP1Q9H0M0 922 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 TRPV6Q9H1D0 765 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 LRMDAQ9H2I8 198 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 KLK15Q9H2R5 256 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 WDR26Q9H7D7 661 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 MAP6D1Q9H9H5 199 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 UGT1A7Q9HAW7 530 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 UGT1A10Q9HAW8 530 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 UGT1A8Q9HAW9 530 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 SAR1AQ9NR31 198 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 TBC1D13Q9NVG8 400 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 DNAJC11Q9NVH1 559 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 TAS2R3Q9NYW6 316 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 RHCGQ9UBD6 479 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 NEU3Q9UQ49 428 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 SCML2Q9UQR0 700 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 TRIM17Q9Y577 477 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 RAI2Q9Y5P3 530 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 SNX10Q9Y5X0 201 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A0C4DFX4 3053 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 TTC3P53804 2025 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 LTBP2Q14767 1821 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 KIAA1671Q9BY89 1806 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A0G2JK05 382 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM92AA1XBS5 289 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 MTMR11A4FU01 709 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 LRRC3CA6NJW4 275 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 KCNU1A8MYU2 1149 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM114B3SHH9 223 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM90A26D6RGX4 464 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 J3KR12 359 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 K7EPI3 171 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 WNT9BO14905 357 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC16A5O15375 505 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 SPINT2O43291 252 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 NARSO43776 548 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 CACNG3O60359 315 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 PLIN3O60664 434 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC22O60826 627 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 SMPD2O60906 423 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 FCGR3BO75015 233 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 SNNO75324 88 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 ATP6V1G2O95670 118 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 FGBP02675 491 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 SERPINE1P05121 402 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 ALPPP05187 535 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 HLA-DQB2P05538 268 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 ERVK-10P10266 1014 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 ALPPL2P10696 532 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 MYL2P10916 166 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 CHRNB1P11230 501 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 EZRP15311 586 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 UGT1A1P22309 533 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 CALB2P22676 271 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 MPZP25189 248 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 DNAJB1P25685 340 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 PTPN4P29074 926 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 MAGEA12P43365 314 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 NDST2P52849 883 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 UCP2P55851 309 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 FOXM1Q08050 763 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 BST1Q10588 318 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 OVGP1Q12889 678 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 IQCCQ4KMZ1 466 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-210ENST00000590211 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms