RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589759.1

ATP6V0A1-223, Transcript of ATPase H+ transporting V0 subunit a1, human

TSL 3

Gene ATP6V0A1, Length 502 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	TMEM218	A2RU14	115 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	BTBD17	A6NE02	478 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	NEMP2	A6NFY4	417 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	NUDT19	A8MXV4	375 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	C5orf58	C9J3I9	102 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759		C9JVG2	144 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759		H7C0S8	307 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	GPR31	O00270	319 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PER2	O15055	1255 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SLC16A4	O15374	487 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PRKY	O43930	277 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SUSD5	O60279	629 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	MPZL2	O60487	215 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ITGA10	O75578	1167 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	RGS11	O94810	467 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	AP2A1	O95782	977 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	LATS1	O95835	1130 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	MT-CO1	P00395	513 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	TCRB	P04435	133 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SERPINA5	P05154	406 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PFKM	P08237	780 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	HCK	P08631	526 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SLC10A3	P09131	477 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	UBB	P0CG47	229 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ADRB3	P13945	408 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	DPEP1	P16444	411 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	TMEM11	P17152	192 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SMPD1	P17405	629 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	NFKB1	P19838	968 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	AGA	P20933	346 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CYP2F1	P24903	491 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PSMB4	P28070	264 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	EPHA2	P29317	976 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	AVPR1A	P37288	418 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	BDKRB1	P46663	353 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	RGS4	P49798	205 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SMS	P52788	366 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CRISP3	P54108	245 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	MTPN	P58546	118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	UFM1	P61960	85 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	RAB33A	Q14088	237 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	IL18	Q14116	193 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	HNF4G	Q14541	408 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	GRIN2C	Q14957	1233 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	P2RY14	Q15391	338 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SLC14A2	Q15849	920 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	GSG1	Q2KHT4	349 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	XKR7	Q5GH72	579 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	NAA40	Q86UY6	237 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CEP97	Q8IW35	865 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	GPR26	Q8NDV2	337 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	IFI44	Q8TCB0	444 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SNX33	Q8WV41	574 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	OSTF1	Q92882	214 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	UBE2F	Q969M7	185 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	R3HDM4	Q96D70	268 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	KCTD7	Q96MP8	289 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	LRFN5	Q96NI6	719 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ZNF599	Q96NL3	588 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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