RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF778Q96MU6 729 aa20.41■□□□□ 0.86
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PTPRM-211ENST00000580170 RETREG1Q9H6L5 497 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 WASF3Q9UPY6 502 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 BPNT1O95861 308 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 RBMXP38159 391 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
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PTPRM-211ENST00000580170 SGIP1Q9BQI5 828 aa20.41■□□□□ 0.86
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PTPRM-211ENST00000580170 GPR83Q9NYM4 423 aa20.41■□□□□ 0.86
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PTPRM-211ENST00000580170 ARSDP51689 593 aa20.4■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 HYLS1Q96M11 299 aa20.4■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 IL17FQ96PD4 163 aa20.4■□□□□ 0.86
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PTPRM-211ENST00000580170 C1orf226A1L170 272 aa20.4■□□□□ 0.86
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PTPRM-211ENST00000580170 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa20.4■□□□□ 0.86
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PTPRM-211ENST00000580170 MSLNLQ96KJ4 702 aa20.4■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 OR2M4Q96R27 311 aa20.4■□□□□ 0.86
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PTPRM-211ENST00000580170 LIPT1Q9Y234 373 aa20.4■□□□□ 0.86
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PTPRM-211ENST00000580170 CCL5P13501 91 aa20.4■□□□□ 0.86
PTPRM-211ENST00000580170 AK4P27144 223 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
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PTPRM-211ENST00000580170 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
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PTPRM-211ENST00000580170 C2orf78A6NCI8 922 aa20.39■□□□□ 0.85
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PTPRM-211ENST00000580170 RORAP35398 523 aa20.38■□□□□ 0.85
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PTPRM-211ENST00000580170 RPS21P63220 83 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 DCDC5Q6ZRR9 648 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 GALNT10Q86SR1 603 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 TMPRSS12Q86WS5 348 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 TP53INP2Q8IXH6 220 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 NPWQ8N729 165 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 ZFP41Q8N8Y5 198 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 OR6C4Q8NGE1 309 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC32Q9BV29 185 aa20.38■□□□□ 0.85
PTPRM-211ENST00000580170 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa20.38■□□□□ 0.85
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