RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	CTAG1A	P78358	180 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	BNC1	Q01954	994 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	TGM3	Q08188	693 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	MYBPH	Q13203	477 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIP10	Q15642	601 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CHRNA6	Q15825	494 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	RAET1L	Q5VY80	246 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CLEC6A	Q6EIG7	209 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CTR9	Q6PD62	1173 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	VSTM4	Q8IW00	320 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF149	Q8NC42	400 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	TRPV3	Q8NET8	790 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	OR4K1	Q8NGD4	311 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PIGC	Q92535	297 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	P3H4	Q92791	437 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ARL5B	Q96KC2	179 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	VSTM2L	Q96N03	204 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ACCS	Q96QU6	501 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	LHPP	Q9H008	270 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	POLD4	Q9HCU8	107 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	IL26	Q9NPH9	171 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF6	Q9Y252	685 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	RIPK3	Q9Y572	518 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP6AP2	A0A1C7CYW4	349 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	MTMR11	A4FU01	709 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PRR23A	A6NEV1	266 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SNTN	A6NMZ2	147 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	GABRR3	A8MPY1	467 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957		H3BTX0	84 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	TULP2	O00295	520 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	KLF11	O14901	512 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNJ13	O60928	360 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	GMNN	O75496	209 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	UPK3A	O75631	287 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	GNA14	O95837	355 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	TXNDC12	O95881	172 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PGK1	P00558	417 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CSTA	P01040	98 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	S100A6	P06703	90 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	FH	P07954	510 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	GSTA2	P09210	222 aa		2.53	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		2.53	□□□□□ -2

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