RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550658.1

SYF2P1-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SYF2P1, Length 413 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2P1-201ENST00000550658 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TSSK1BQ9BXA7 367 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ENKD1Q9H0I2 346 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PIGMQ9H3S5 423 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ASB8Q9H765 288 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TBC1D17Q9HA65 648 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CALHM2Q9HA72 323 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SAP30LQ9HAJ7 183 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 MYNNQ9NPC7 610 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ADAP2Q9NPF8 381 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TREX1Q9NSU2 369 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ECHDC1Q9NTX5 307 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 UFSP2Q9NUQ7 469 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 POT1Q9NUX5 634 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ELOVL2Q9NXB9 296 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 MS4A12Q9NXJ0 267 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SPHK1Q9NYA1 384 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PLEK2Q9NYT0 353 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 USE1Q9NZ43 259 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CD274Q9NZQ7 290 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 FLRT1Q9NZU1 646 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC7A8Q9UHI5 535 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF229Q9UJW7 825 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PACSIN3Q9UKS6 424 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 IKZF2Q9UKS7 526 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 VANGL2Q9ULK5 521 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 LRP12Q9Y561 859 aa3.3□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 NEURL4Q96JN8 1562 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CDHR2Q9BYE9 1310 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 A0A1B0GVL5 298 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 GRID2IPA4D2P6 1211 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 DPPA5A6NC42 116 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SMCO2A6NFE2 343 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ZAR1LA6NP61 321 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 FAM157AC9JC47 383 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 E5RI56 91 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 I6L893 689 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 M0R296 226 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 LEFTY2O00292 366 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SDHDO14521 159 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC22A2O15244 555 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ZSCAN12O43309 604 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 XRCC3O43542 346 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 OR1F1O43749 312 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 OR10H3O60404 316 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF217O75362 1048 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 LRCH4O75427 683 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 RPS6KA5O75582 802 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ZFPL1O95159 310 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 RAB3DO95716 219 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 HMGN1P05114 100 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 GSTA2P09210 222 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SP9P0CG40 484 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PPIAL4GP0DN37 164 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CETPP11597 493 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 NAGAP17050 411 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 MMP11P24347 488 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 P2RY2P41231 377 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 MAGEA2P43356 314 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ACADSBP45954 432 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 RFX3P48380 749 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 AGTR2P50052 363 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CYP2J2P51589 502 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 MAPK12P53778 367 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 GEMP55040 296 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 NXPH1P58417 271 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 UBE2G2P60604 165 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 RAB4BP61018 213 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CFHR1Q03591 330 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SCRN3Q0VDG4 424 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TRAF2Q12933 501 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CRMP1Q14194 572 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 MFSD13AQ14CX5 517 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TSC22D1Q15714 1073 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 ETFDHQ16134 617 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 EXT1Q16394 746 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 PTGISQ16647 500 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 MICBQ29980 383 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 KLHL22Q53GT1 634 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 XKR6Q5GH73 641 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CEP85LQ5SZL2 805 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 CES5AQ6NT32 575 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 C11orf63Q6NUN7 778 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 BTNL8Q6UX41 500 aa3.29□□□□□ -1.88
SYF2P1-201ENST00000550658 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa3.29□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms