RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548025.5

MARF1-205, Transcript of meiosis regulator and mRNA stability factor 1, human

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MARF1, Length 5,891 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MARF1-205	ENST00000548025	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MARF1-205	ENST00000548025	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	10.15	□□□□□ -0.78
MARF1-205	ENST00000548025	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MARF1-205	ENST00000548025	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MARF1-205	ENST00000548025	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MARF1-205	ENST00000548025	MGME1	Q9BQP7	344 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MARF1-205	ENST00000548025	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MARF1-205	ENST00000548025	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
MARF1-205	ENST00000548025	TRBC2	A0A5B9	178 aa		10.15	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	HDAC3	O15379	428 aa		10.15	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	ITGA10	O75578	1167 aa		10.15	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	HIST1H1T	P22492	207 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	PTGER4	P35408	488 aa		10.15	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	TBPL1	P62380	186 aa		10.15	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	TLE3	Q04726	772 aa		10.15	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		10.15	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		10.15	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		10.15	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	OR2T12	Q8NG77	320 aa		10.15	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	TMEM68	Q96MH6	324 aa		10.15	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	RANBP9	Q96S59	729 aa		10.15	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	AGAP2	Q99490	1192 aa		10.15	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		10.15	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		10.15	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	OR6C76	A6NM76	312 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	LMO7DN	F2Z398	122 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	SCEL	O95171	688 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	CRYAA	P02489	173 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	NR4A1	P22736	598 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	FPR2	P25090	351 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	TPTE	P56180	551 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	GAB1	Q13480	694 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	NLRP14	Q86W24	1093 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	OR7G1	Q8NGA0	311 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	UBE2F	Q969M7	185 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	JMJD8	Q96S16	334 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	SLC30A3	Q99726	388 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	DTL	Q9NZJ0	730 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	ARPC2	O15144	300 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	NIPSNAP2	O75323	286 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	PRSS56	P0CW18	603 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	IKZF1	Q13422	519 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	CARF	Q8N187	725 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	DMAC2	Q9NW81	257 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	LRFN1	Q9P244	771 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025		A0A096LPI6	279 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025		A0A1W2PQ09	198 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	OR4F21	O95013	312 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	STATH	P02808	62 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	NMBR	P28336	390 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	PON3	Q15166	354 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	SLC25A25	Q6KCM7	469 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	M1AP	Q8TC57	530 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	SATB2	Q9UPW6	733 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	AP4S1	Q9Y587	144 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	SPEF2	Q9C093	1822 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	MAP2K4	P45985	399 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	ALDH3A2	P51648	485 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	TAS2R40	P59535	323 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	HERV-K104	P61576	105 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	GINS4	Q9BRT9	223 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MARF1-205	ENST00000548025	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79

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