RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545264.1

CCDC82-208, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC82, Length 557 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-208ENST00000545264 FAM46BQ96A09 425 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 CAPNS2Q96L46 248 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 CXorf58Q96LI9 332 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 PAXXQ9BUH6 204 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 CACNG6Q9BXT2 260 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 SPG21Q9NZD8 308 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 CNIH4Q9P003 139 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 IKZF3Q9UKT9 509 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 ATG4BQ9Y4P1 393 aa3.35□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 A0A0U1RQK1 487 aa3.34□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 ZNF320A2RRD8 509 aa3.34□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 TRABD2BA6NFA1 517 aa3.34□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 YJEFN3A6XGL0 299 aa3.34□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 PSMD3O43242 534 aa3.34□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 PRAMEF12O95522 483 aa3.34□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 NUDT14O95848 222 aa3.34□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 TXNDC12O95881 172 aa3.34□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 FCER2P06734 321 aa3.34□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 GLULP15104 373 aa3.34□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 PGAM2P15259 253 aa3.34□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 ATP6V1B1P15313 513 aa3.34□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 CYP3A5P20815 502 aa3.34□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 RGRP47804 291 aa3.34□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 SLC7A2P52569 658 aa3.34□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 STX1BP61266 288 aa3.34□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 CXCL6P80162 114 aa3.34□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 ROR1Q01973 937 aa3.34□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 PAX2Q02962 417 aa3.34□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 TRADDQ15628 312 aa3.34□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 MICAQ29983 383 aa3.34□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa3.34□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 MPPE1Q53F39 396 aa3.34□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 ARMC3Q5W041 872 aa3.34□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 APOOLQ6UXV4 268 aa3.34□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 GDAP1Q8TB36 358 aa3.34□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 GLYATL1Q969I3 302 aa3.34□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 RAB3CQ96E17 227 aa3.34□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 PHYHIPLQ96FC7 376 aa3.34□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 PRAM1Q96QH2 718 aa3.34□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 C19orf43Q9BQ61 176 aa3.34□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 SLC26A1Q9H2B4 701 aa3.34□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 MAGEF1Q9HAY2 307 aa3.34□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 TIGARQ9NQ88 270 aa3.34□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 IMPAD1Q9NX62 359 aa3.34□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 VNN3Q9NY84 501 aa3.34□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 CLIP2Q9UDT6 1046 aa3.34□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 CLEC4EQ9ULY5 219 aa3.34□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 FAM205AQ6ZU69 1335 aa3.34□□□□□ -1.87
CCDC82-208ENST00000545264 CCT8L1PA6NM43 557 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 FAM220BPB1ANY3 271 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 E7ENQ6 273 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 K7ERI5 159 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 TNFSF11O14788 317 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 VCLP18206 1134 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 ZBTB25P24278 435 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 TKTL1P51854 596 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 RTL6Q6ICC9 239 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 STEAP1BQ6NZ63 245 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 GCNT7Q6ZNI0 430 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 KCTD9Q7L273 389 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 FBXW8Q8N3Y1 598 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 BIRC7Q96CA5 298 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 CCT8L2Q96SF2 557 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 GANQ9H2C0 597 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 PNPLA3Q9NST1 481 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 RAI14Q9P0K7 980 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 AFF2P51816 1311 aa3.33□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 EFCAB7A8K855 629 aa3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 GPAA1O43292 621 aa3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 GMNNO75496 209 aa3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 UROSP10746 265 aa3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 UCP1P25874 307 aa3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 GEMP55040 296 aa3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 SLC10A1Q14973 349 aa3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 HAGHQ16775 308 aa3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 C2orf66Q6UXQ4 117 aa3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 GPR142Q7Z601 462 aa3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 LINC00518Q8N0U6 118 aa3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 NKAIN3Q8N8D7 197 aa3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 CFAP36Q96G28 342 aa3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 COG3Q96JB2 828 aa3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 FUNDC2Q9BWH2 189 aa3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 PDFQ9HBH1 243 aa3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 ADGRL4Q9HBW9 690 aa3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 DNAJC11Q9NVH1 559 aa3.32□□□□□ -1.88
CCDC82-208ENST00000545264 GJB5O95377 273 aa3.31□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms