RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542324.6

CS-202, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CS, Length 1,893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-202ENST00000542324 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa10□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 CKBP12277 381 aa10□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 ATP12AP54707 1039 aa10□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 CASP9P55211 416 aa10□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 GINS1Q14691 196 aa10□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 FLYWCH1Q4VC44 716 aa10□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 SYTL3Q4VX76 610 aa10□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 HSD17B12Q53GQ0 312 aa10□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 ENTPD8Q5MY95 495 aa10□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 ZBTB37Q5TC79 503 aa10□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 C17orf99Q6UX52 265 aa10□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 OTOP2Q7RTS6 562 aa10□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 TMPRSS11BQ86T26 416 aa10□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 ANKK1Q8NFD2 765 aa10□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 OR5AK3PQ8NH89 298 aa10□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 TM9SF4Q92544 642 aa10□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 TMEM159Q96B96 161 aa10□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 FOPNLQ96NB1 174 aa10□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 CASD1Q96PB1 797 aa10□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 ZNF607Q96SK3 696 aa10□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 EMC7Q9NPA0 242 aa10□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 ASB6Q9NWX5 421 aa10□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 NLKQ9UBE8 527 aa10□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 ING4Q9UNL4 249 aa10□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 SLC5A10A0PJK1 596 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 C7orf66A4D0T2 115 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 PDPK1O15530 556 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 CHST10O43529 356 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 HPGDSO60760 199 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 MMP20O60882 483 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 NME6O75414 186 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 HLA-DPB1P04440 258 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 GIPRP48546 466 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 TAS2R50P59544 299 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 FABP5Q01469 135 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 CNTN1Q12860 1018 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 LMAN2Q12907 356 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 PLD1Q13393 1074 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 IL18Q14116 193 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 KCNA10Q16322 511 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 ADNP2Q6IQ32 1131 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 C22orf39Q6P5X5 142 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 TMEM107Q6UX40 140 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 RFLNAQ6ZTI6 216 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 AMIGO1Q86WK6 493 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 TRAM1L1Q8N609 369 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 SLC37A3Q8NCC5 494 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 ZNF485Q8NCK3 441 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 FIBINQ8TAL6 211 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 NR4A3Q92570 626 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 NEIL2Q969S2 332 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 TMEM19Q96HH6 336 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 LRR1Q96L50 414 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 CXorf36Q9H7Y0 433 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 NEUROD4Q9HD90 331 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 COMMD3Q9UBI1 195 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 B4GALT6Q9UBX8 382 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 CBLCQ9ULV8 474 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 OBSL1O75147 1896 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 HOXA2O43364 376 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 AKR7A2O43488 359 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 SLC22A5O76082 557 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 KLHL18O94889 574 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 OLFM2O95897 454 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 BCHEP06276 602 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 SSTR4P31391 388 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 BDKRB1P46663 353 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 MAPK12P53778 367 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 MC1RQ01726 317 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 TAF12Q16514 161 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 MPPE1Q53F39 396 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 TOR2AQ5JU69 321 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 TPGS2Q68CL5 300 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 C1orf94Q6P1W5 598 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 HORMAD2Q8N7B1 307 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 SYT14Q8NB59 555 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 WDR48Q8TAF3 677 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 SLC38A5Q8WUX1 472 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-202ENST00000542324 UCN3Q969E3 161 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 147.4 ms