RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 ZER1Q7Z7L7 766 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 IFI44Q8TCB0 444 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 TRIM63Q969Q1 353 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 SCGB3A2Q96PL1 93 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 TIMM29Q9BSF4 260 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 MALT1Q9UDY8 824 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 PGAP2Q9UHJ9 254 aa9.03□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 C5orf51A6NDU8 294 aa9.02□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 DRGXA6NNA5 263 aa9.02□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 PLATP00750 562 aa9.02□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 ICAM2P13598 275 aa9.02□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 IL32P24001 234 aa9.02□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 RPS26P62854 115 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 KCTD21Q4G0X4 260 aa9.02□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 MPP7Q5T2T1 576 aa9.02□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 LCTLQ6UWM7 567 aa9.02□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 TCTN2Q96GX1 697 aa9.02□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM41AQ96HV5 264 aa9.02□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 ARL5BQ96KC2 179 aa9.02□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa9.02□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 OR51B6Q9H340 312 aa9.02□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 MARCH5Q9NX47 278 aa9.02□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 MBD2Q9UBB5 411 aa9.02□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 SARDHQ9UL12 918 aa9.02□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 EDARQ9UNE0 448 aa9.02□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 GLI3P10071 1580 aa9.02□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 RORCP51449 518 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 PCLAFQ15004 111 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 PLGLAQ15195 96 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 MARCH9Q86YJ5 346 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 CROCCP3Q8IVE0 287 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 VDAC3Q9Y277 283 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 CPOXP36551 454 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 RPL5P46777 297 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 BNIP3Q12983 259 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 GRHL2Q6ISB3 625 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 EPGNQ6UW88 154 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 TIFABQ6ZNK6 161 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 GAREM2Q75VX8 874 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 P2RY8Q86VZ1 359 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 IGDCC3Q8IVU1 814 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 HS6ST2Q96MM7 605 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 STRA6Q9BX79 667 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 NUAK1O60285 661 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 TRMUO75648 421 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 RLN2P04090 185 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 DSG2Q14126 1118 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 GXYLT1Q4G148 440 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 C3orf33Q6P1S2 294 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 TEX19Q8NA77 164 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 ELP5Q8TE02 316 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 ACTRT3Q9BYD9 372 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 OBP2AQ9NY56 170 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 MGAT4BQ9UQ53 548 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 TRIM64BA6NI03 449 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 E2F3O00716 465 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 PVRP15151 417 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 WNT7BP56706 349 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 MGAT3Q09327 533 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 NPRL3Q12980 569 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 OR4D1Q15615 310 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 UGT3A2Q3SY77 523 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 RAB6CQ53S08 254 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 USP43Q70EL4 1123 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 STX12Q86Y82 276 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 RHEBL1Q8TAI7 183 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 LRRC15Q8TF66 581 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 C10orf82Q8WW14 230 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 TMBIM1Q969X1 311 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 FBXL8Q96CD0 374 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 SHISA4Q96DD7 197 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 RAB6CQ9H0N0 254 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 CXorf56Q9H5V9 222 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 COMMD3Q9UBI1 195 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 PSAT1Q9Y617 370 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 HLA-FP30511 346 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 GRPRP30550 384 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 CLCN2P51788 898 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 DCDP81605 110 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 CDKL1Q00532 357 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP9.01□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 GPR26Q8NDV2 337 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 OR9K2Q8NGE7 335 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRB-204ENST00000538708 LMO3Q8TAP4 145 aa9.01□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 97.2 ms