RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534382.5

CTSB-231, Transcript of cathepsin B, human

TSL 4

Gene CTSB, Length 764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSB-231	ENST00000534382	NEFH	P12036	1026 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	EDN3	P14138	238 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	SSTR4	P31391	388 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	ARRB2	P32121	409 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	SOX3	P41225	446 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	ZNF763	Q0D2J5	394 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	FUT7	Q11130	342 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	MAP4K2	Q12851	820 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	MPP2	Q14168	576 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	KIAA0040	Q15053	153 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	NOXRED1	Q6NXP6	359 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382		Q6ZSR9	355 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	ZNF681	Q96N22	645 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	HPF1	Q9NWY4	346 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	C1orf109	Q9NX04	203 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	EHD3	Q9NZN3	535 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		13.45	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	RELN	P78509	3460 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	WDR91	A4D1P6	747 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	ASPDH	A6ND91	283 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	TMEM233	B4DJY2	109 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	CLPS	P04118	112 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	DDC	P20711	480 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	S1PR1	P21453	382 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	PMP22	Q01453	160 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	DUSP2	Q05923	314 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	C2orf80	Q0P641	193 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	EBP	Q15125	230 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	FAM71E1	Q6IPT2	247 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	OPN5	Q6U736	354 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	MDGA2	Q7Z553	956 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	LRRC25	Q8N386	305 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	SLC15A4	Q8N697	577 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	ZNF615	Q8N8J6	731 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	OR7G1	Q8NGA0	311 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	OR2T11	Q8NH01	316 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	13.44	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	AGR3	Q8TD06	166 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	FRMD6	Q96NE9	622 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	WWTR1	Q9GZV5	400 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	MYNN	Q9NPC7	610 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	PIP5K1B	O14986	540 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	SERPINE1	P05121	402 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	MST1	P26927	711 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	TDGF1P3	P51864	188 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	13.43	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	MGAT2	Q10469	447 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	CASP8	Q14790	479 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	CHI3L2	Q15782	390 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	SULF2	Q8IWU5	870 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	PRR7	Q8TB68	274 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	SGCZ	Q96LD1	299 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	GAL3ST4	Q96RP7	486 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	OR10A5	Q9H207	317 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTSB-231	ENST00000534382	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		13.43	□□□□□ -0.26

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