RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532785.1

LMO7-222, Transcript of LIM domain 7, human

TSL 2

Gene LMO7, Length 599 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LMO7-222	ENST00000532785	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	UROS	P10746	265 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	VCL	P18206	1134 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	ATRX	P46100	2492 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	SLC10A1	Q14973	349 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	MOB2	Q70IA6	237 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	ZNF525	Q8N782	197 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	EPSTI1	Q96J88	318 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	DEFB126	Q9BYW3	111 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	AFF2	P51816	1311 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785		A0A1W2PRQ8	180 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	EFCAB7	A8K855	629 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	TSPAN2	O60636	221 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	PGAM2	P15259	253 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	GDF1	P27539	372 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	SLC25A1	P53007	311 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	KRT31	Q15323	416 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	MICA	Q29983	383 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	COG3	Q96JB2	828 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	PRAM1	Q96QH2	718 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	GAN	Q9H2C0	597 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785		Q9UF83	564 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	TNFSF11	O14788	317 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	TGDS	O95455	350 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	TXNDC12	O95881	172 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	FCER2	P06734	321 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	FER	P16591	822 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	ZBTB25	P24278	435 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	FAS	P25445	335 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	CGB2	Q6NT52	195 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	SLC34A3	Q8N130	599 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	CYYR1	Q96J86	154 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	MAPKAP1	Q9BPZ7	522 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	STX8	Q9UNK0	236 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
LMO7-222	ENST00000532785	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMO7-222	ENST00000532785	SFTPB	P07988	381 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMO7-222	ENST00000532785	ATP6V1B1	P15313	513 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMO7-222	ENST00000532785	CYP3A5	P20815	502 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMO7-222	ENST00000532785	UCP1	P25874	307 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMO7-222	ENST00000532785	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LMO7-222	ENST00000532785	PRKCE	Q02156	737 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMO7-222	ENST00000532785	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LMO7-222	ENST00000532785	SLMAP	Q14BN4	828 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMO7-222	ENST00000532785	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMO7-222	ENST00000532785	VASH2	Q86V25	355 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMO7-222	ENST00000532785	STH	Q8IWL8	128 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMO7-222	ENST00000532785	RDH11	Q8TC12	318 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMO7-222	ENST00000532785	BIRC7	Q96CA5	298 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMO7-222	ENST00000532785	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMO7-222	ENST00000532785	FUT8	Q9BYC5	575 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMO7-222	ENST00000532785	DCTPP1	Q9H773	170 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMO7-222	ENST00000532785	RAI14	Q9P0K7	980 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMO7-222	ENST00000532785	SLC7A4	O43246	635 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-222	ENST00000532785	GPAA1	O43292	621 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-222	ENST00000532785	ZNF19	P17023	458 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-222	ENST00000532785	DRD3	P35462	400 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-222	ENST00000532785	TNFRSF4	P43489	277 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-222	ENST00000532785	TKTL1	P51854	596 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-222	ENST00000532785	SMS	P52788	366 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-222	ENST00000532785	PAX2	Q02962	417 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-222	ENST00000532785	ZNF79	Q15937	498 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-222	ENST00000532785	HAGH	Q16775	308 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-222	ENST00000532785	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-222	ENST00000532785	ASRGL1	Q7L266	308 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-222	ENST00000532785	KRT77	Q7Z794	578 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-222	ENST00000532785	LUZP1	Q86V48	1076 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-222	ENST00000532785	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-222	ENST00000532785	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-222	ENST00000532785	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-222	ENST00000532785	PRODH2	Q9UF12	536 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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