RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 CLN3Q13286 438 aa21.25■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 SZRD1Q7Z422 152 aa21.25■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 OR7G2Q8NG99 324 aa21.25■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 RIT1Q92963 219 aa21.25■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 RMND5AQ9H871 391 aa21.25■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 PADI2Q9Y2J8 665 aa21.25■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa21.25■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC88CQ9P219 2028 aa21.24■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 C17orf105B2RV13 164 aa21.24■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 C21orf140B9A014 251 aa21.24■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 EBAG9O00559 213 aa21.24■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 ATP1B1P05026 303 aa21.24■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 WT1P19544 449 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 PRDX6P30041 224 aa21.24■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 MGAT2Q10469 447 aa21.24■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 STX5Q13190 355 aa21.24■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 NFYCQ13952 458 aa21.24■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 SERTAD2Q14140 314 aa21.24■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 DLEU7Q6UYE1 221 aa21.24■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 MSRB3Q8IXL7 192 aa21.24■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 CNPPD1Q9BV87 410 aa21.24■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 CXorf21Q9HAI6 301 aa21.24■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa21.24■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 BTNL2Q9UIR0 455 aa21.24■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa21.24■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 PTPN6P29350 595 aa21.23■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa21.23■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF628Q5EBL2 1059 aa21.23■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa21.23■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 TSPEARQ8WU66 669 aa21.23■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 GPR87Q9BY21 358 aa21.23■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 TAS2R9Q9NYW1 312 aa21.23■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 MAT2BQ9NZL9 334 aa21.23■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 VAPAQ9P0L0 249 aa21.23■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 PCDHGB4Q9UN71 923 aa21.23■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa21.23■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 CROCCQ5TZA2 2017 aa21.23■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 ANP32DO95626 131 aa21.23■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 DDX5P17844 614 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 SSTR4P31391 388 aa21.23■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 PRKAG1P54619 331 aa21.23■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 CPZQ66K79 652 aa21.23■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM205Q6UW68 189 aa21.23■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 KIRREL2Q6UWL6 708 aa21.23■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 RINLQ6ZS11 566 aa21.23■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 FGF11Q92914 225 aa21.23■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 ELP4Q96EB1 424 aa21.23■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC25A3Q00325 362 aa21.22■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa21.22■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 DHDDSQ86SQ9 333 aa21.22■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 GALNT12Q8IXK2 581 aa21.22■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 ZFP28Q8NHY6 868 aa21.22■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 OR8D2Q9GZM6 311 aa21.22■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 ERVK-19Q9WJR5 959 aa21.22■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa21.22■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa21.22■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 DYTNA2CJ06 578 aa21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 B2RBV5 119 aa21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 SPDYE7PQ495Y7 208 aa21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 EFCAB1Q9HAE3 211 aa21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 ADAP2Q9NPF8 381 aa21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 SEMA3GQ9NS98 782 aa21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 BBIP1A8MTZ0 92 aa21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 FXYD1O00168 92 aa21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 UPK1AO00322 258 aa21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 SOCS6O14544 535 aa21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 KCNH1O95259 989 aa21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 MMP11P24347 488 aa21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 RPS26P62854 115 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 BNIP1Q12981 228 aa21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 DUSP8Q13202 625 aa21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 ART3Q13508 389 aa21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 VWA5B2Q8N398 1253 aa21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 DPP10Q8N608 796 aa21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 IKZF5Q9H5V7 419 aa21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 EQTNQ9NQ60 294 aa21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 KCND3Q9UK17 655 aa21.21■□□□□ 0.99
TSNARE1-208ENST00000524325 A0A096LPI6 279 aa21.2■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 S1PR1P21453 382 aa21.2■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 CALB2P22676 271 aa21.2■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 MXRA7P84157 204 aa21.2■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 SELPLGQ14242 412 aa21.2■□□□□ 0.98
TSNARE1-208ENST00000524325 MLC1Q15049 377 aa21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms