RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 ARCQ7LC44 396 aa3.95□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 SLC26A11Q86WA9 606 aa3.95□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 PDIK1LQ8N165 341 aa3.95□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 ARHGAP18Q8N392 663 aa3.95□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 SLC4A11Q8NBS3 891 aa3.95□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 OR5B17Q8NGF7 314 aa3.95□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 ZNF519Q8TB69 540 aa3.95□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 CCDC110Q8TBZ0 833 aa3.95□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 PYROXD1Q8WU10 500 aa3.95□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 UCMAQ8WVF2 138 aa3.95□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 ZNF606Q8WXB4 792 aa3.95□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 FAF2Q96CS3 445 aa3.95□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 LRRC39Q96DD0 335 aa3.95□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 SERAC1Q96JX3 654 aa3.95□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 C12orf42Q96LP6 360 aa3.95□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 TAAR1Q96RJ0 339 aa3.95□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 TSC22D3Q99576 134 aa3.95□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 TMEM121Q9BTD3 319 aa3.95□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 YIPF3Q9GZM5 350 aa3.95□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 NMUR2Q9GZQ4 415 aa3.95□□□□□ -1.78
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SGCE-211ENST00000522045 SDCBP2Q9H190 292 aa3.95□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 C1orf21Q9H246 121 aa3.95□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 LHX5Q9H2C1 402 aa3.95□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 TAS2R1Q9NYW7 299 aa3.95□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa3.95□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 PARP14Q460N5 1801 aa3.95□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 A0A0G2JMZ2 1700 aa3.95□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 LRRC37A2A6NM11 1700 aa3.95□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP3.95□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 DOCK5Q9H7D0 1870 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 A0A0G2JND7 137 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 CLRN2A0PK11 232 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 FAM159BA6NKW6 160 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 TCP10L2B9ZVM9 353 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 TRIM49D1C9J1S8 452 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 I3L4J1 428 aa3.94□□□□□ -1.78
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SGCE-211ENST00000522045 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 GYG2O15488 501 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 IDH3BO43837 385 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 CST8O60676 142 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 CIB2O75838 187 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 IFNB1P01574 187 aa3.94□□□□□ -1.78
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SGCE-211ENST00000522045 SERPINA6P08185 405 aa3.94□□□□□ -1.78
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SGCE-211ENST00000522045 CCDC130P13994 396 aa3.94□□□□□ -1.78
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SGCE-211ENST00000522045 KDELR1P24390 212 aa3.94□□□□□ -1.78
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SGCE-211ENST00000522045 PRDX6P30041 224 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 HSPA1LP34931 641 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 PEX19P40855 299 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 OPRL1P41146 370 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 SSR1P43307 286 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 SERPINB9P50453 376 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 CCR9P51686 369 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 HERV-K104P61576 105 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 CX3CL1P78423 397 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 SARNPP82979 210 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 ROR1Q01973 937 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 NAB1Q13506 487 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 MED22Q15528 200 aa3.94□□□□□ -1.78
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SGCE-211ENST00000522045 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 RABGAP1LQ5R372 815 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 DCUN1D2Q6PH85 259 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 C4orf22Q6V702 233 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 CFAP77Q6ZQR2 320 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 Q6ZRP5 223 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 CYS1Q717R9 158 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 DHDDSQ86SQ9 333 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 LRRC6Q86X45 466 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 ZNF584Q8IVC4 421 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 UNC45BQ8IWX7 931 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 C11orf53Q8IXP5 236 aa3.94□□□□□ -1.78
SGCE-211ENST00000522045 WDTC1Q8N5D0 677 aa3.94□□□□□ -1.78
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