RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 DOCK6Q96HP0 2047 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 TRAV20A0A0B4J274 112 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 WASH3PC4AMC7 463 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 AP2A2O94973 939 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 OPRD1P41143 372 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 CSNK2BP67870 215 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 MAMSTRQ6ZN01 415 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF367Q7RTV3 350 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF605Q86T29 641 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 RASGRP3Q8IV61 690 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 LIX1Q8N485 282 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 SPEM1Q8N4L4 309 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 RBCK1Q9BYM8 510 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 SUV39H2Q9H5I1 410 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 RAI2Q9Y5P3 530 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 ISM1B1AKI9 464 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 PROM1O43490 865 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 PRSS56P0CW18 603 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 GNSP15586 552 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 FCARP24071 287 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 GZMMP51124 257 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 ERVPABLB-1P60509 514 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 PUDPQ08623 228 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 AP5B1Q2VPB7 878 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 BCL2L15Q5TBC7 163 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 TRIQKQ629K1 86 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 IL27RAQ6UWB1 636 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 OR7G3Q8NG95 312 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 OR52E4Q8NGH9 312 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM203Q969S6 136 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM245Q9H330 911 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 ING4Q9UNL4 249 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 CACNG2Q9Y698 323 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa9.6□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 PRSS44E7EML9 344 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 ORC5O43913 435 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 ADAM11O75078 769 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 IFNA7P01567 189 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 SRCP12931 536 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 RAB3AP20336 220 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 LHCGRP22888 699 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 ADRA1AP35348 466 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 DSC2Q02487 901 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 COL28A1Q2UY09 1125 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 RTL4Q6ZR62 310 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 ULK4Q96C45 1275 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 LRIG1Q96JA1 1093 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 CXorf58Q96LI9 332 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 LDAHQ9H6V9 325 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 FKBP7Q9Y680 259 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 WASH4PA8MWX3 477 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 K7ERQ8 282 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 TSPAN12O95859 305 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 RPS17P08708 135 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 ELFN1P0C7U0 828 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 GABRB1P18505 474 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 AKT1P31749 480 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 ETFDHQ16134 617 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 KLHL22Q53GT1 634 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 GHDCQ8N2G8 530 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 OR8D4Q8NGM9 314 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 FEVQ99581 238 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 GSX2Q9BZM3 304 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 PIGUQ9H490 435 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 MTG2Q9H4K7 406 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 CATSPERZQ9NTU4 200 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 PCTPQ9UKL6 214 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 SLC7A4O43246 635 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 GMDSO60547 372 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 PRAMEF10O60809 474 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 SLC43A1O75387 559 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 FABP3P05413 133 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 CTPS1P17812 591 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 F8A1P23610 371 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 RAB14P61106 215 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 ZXDBP98169 803 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 ERICH5Q6P6B1 374 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 BHLHB9Q6PI77 547 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 C12orf40Q86WS4 652 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 SYT14Q8NB59 555 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 SLC25A46Q96AG3 418 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 MS4A3Q96HJ5 214 aa9.59□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 INPP5KQ9BT40 448 aa9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms