RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511955.5

TRAPPC11-208, Transcript of trafficking protein particle complex 11, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC11, Length 2,342 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11-208ENST00000511955 CSPG4P5Q96PW8 444 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 DIRC2Q96SL1 478 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 CD180Q99467 661 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 APOL2Q9BQE5 337 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 CLSTN3Q9BQT9 956 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 ZNF559Q9BR84 538 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 CDIP1Q9H305 208 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 APMAPQ9HDC9 416 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 GID8Q9NWU2 228 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 MTMR10Q9NXD2 777 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 ADAM22Q9P0K1 906 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 HSPB7Q9UBY9 170 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 RAB23Q9ULC3 237 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 KCTD3Q9Y597 815 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 STYXL1Q9Y6J8 313 aa4.76□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 LOC100509620A0A075B734 347 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 BDP1A6H8Y1 2624 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 WIPF3A6NGB9 483 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 C5orf52A6NGY3 159 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 ZNF98A6NK75 572 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 CGB1A6NKQ9 187 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 SLC38A8A6NNN8 435 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 F2RL2O00254 374 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 KLF11O14901 512 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 AURKAO14965 403 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 MID1O15344 667 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 FCMRO60667 390 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 CCNKO75909 580 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 MT-ND1P03886 318 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 LYNP07948 512 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 CD63P08962 238 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 ELFN1P0C7U0 828 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 CD72P21854 359 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 PTPN7P35236 360 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 PTGER4P35408 488 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 OMPP47874 163 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 GCLMP48507 274 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 CXCR3P49682 368 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 SEC61GP60059 68 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 MMRN1Q13201 1228 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 NAB2Q15742 525 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 UPP1Q16831 310 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 CYB5R2Q6BCY4 276 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 FCRL6Q6DN72 434 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 PAQR3Q6TCH7 311 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 ALKAL1Q6UXT8 129 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 SLCO6A1Q86UG4 719 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 WFDC3Q8IUB2 231 aa4.75□□□□□ -1.65
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TRAPPC11-208ENST00000511955 BBS7Q8IWZ6 715 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 SLC39A11Q8N1S5 342 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 CCDC185Q8N715 623 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 PLEKHO2Q8TD55 490 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 DLG3Q92796 817 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 NTAN1Q96AB6 310 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 VN1R3Q9BXE9 311 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 GSDMCQ9BYG8 508 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 OR2B2Q9GZK3 357 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 SLC25A32Q9H2D1 315 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 CCDC134Q9H6E4 229 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 POT1Q9NUX5 634 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 MARCH5Q9NX47 278 aa4.75□□□□□ -1.65
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TRAPPC11-208ENST00000511955 PEMTQ9UBM1 199 aa4.75□□□□□ -1.65
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TRAPPC11-208ENST00000511955 HYOU1Q9Y4L1 999 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 A0A1W2PPM1 405 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 CLEC18AA5D8T8 446 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 C2orf78A6NCI8 922 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 DRGXA6NNA5 263 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 H0YIG0 161 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 H3BMM5 538 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 ADAM23O75077 832 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 TJP3O95049 919 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 MOCS3O95396 460 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 BRI3O95415 125 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 TNNC2P02585 160 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 GIMD1P0DJR0 217 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 PPP3CBP16298 524 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 ZNF18P17022 549 aa4.75□□□□□ -1.65
TRAPPC11-208ENST00000511955 UGT1A4P22310 534 aa4.75□□□□□ -1.65
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