RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 TCP10LQ8TDR4 215 aa17.3■□□□□ 0.36
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SH3BP2-218ENST00000511185 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 ART5Q96L15 291 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 GPR137Q96N19 417 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
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SH3BP2-218ENST00000511185 ARRB2P32121 409 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 XKP51811 444 aa17.29■□□□□ 0.36
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SH3BP2-218ENST00000511185 C4orf17Q53FE4 359 aa17.29■□□□□ 0.36
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SH3BP2-218ENST00000511185 FAM111BQ6SJ93 734 aa17.28■□□□□ 0.36
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SH3BP2-218ENST00000511185 FGD2Q7Z6J4 655 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF615Q8N8J6 731 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF441Q8N8Z8 693 aa17.28■□□□□ 0.36
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SH3BP2-218ENST00000511185 CDC26Q8NHZ8 85 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 C16orf78Q8WTQ4 265 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 NMRK1Q9NWW6 199 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 MAT2BQ9NZL9 334 aa17.28■□□□□ 0.36
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SH3BP2-218ENST00000511185 CLDN1O95832 211 aa17.27■□□□□ 0.36
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SH3BP2-218ENST00000511185 MPEG1Q2M385 716 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 PIGGQ5H8A4 983 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 RTL4Q6ZR62 310 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC29A4Q7RTT9 530 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa17.27■□□□□ 0.36
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SH3BP2-218ENST00000511185 OR2T11Q8NH01 316 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF681Q96N22 645 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM109Q9BVC6 243 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 BRINP2Q9C0B6 783 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 TUBB1Q9H4B7 451 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKRA2Q9H9E1 313 aa17.27■□□□□ 0.36
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SH3BP2-218ENST00000511185 UTS2RQ9UKP6 389 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 CCL27Q9Y4X3 112 aa17.27■□□□□ 0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC151A5D8V7 595 aa17.26■□□□□ 0.35
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SH3BP2-218ENST00000511185 GUCY1B2O75343 617 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 ATP1B1P05026 303 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 DNASE1L1P49184 302 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 IMPG1Q17R60 797 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 SPDYAQ5MJ70 313 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 PRAMEF20Q5VT98 475 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 CES4AQ5XG92 561 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 KANK2Q63ZY3 851 aa17.26■□□□□ 0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 GALNT18Q6P9A2 607 aa17.26■□□□□ 0.35
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