RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509876.5

PHF3-210, Transcript of PHD finger protein 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PHF3, Length 7,124 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3-210ENST00000509876 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 E7ENX8 843 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 H0YIG0 161 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 ANKRD28O15084 1053 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 MAGEB3O15480 346 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 CLOCKO15516 846 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 TYROBPO43914 113 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 MPZL2O60487 215 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 FARS2O95363 451 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 CREB1P16220 341 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 GPR143P51810 404 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 METAP1P53582 386 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 UCNP55089 124 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 TAP2Q03519 686 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 OR52R1Q8NGF1 315 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 PATE1Q8WXA2 126 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 MYDGFQ969H8 173 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 OR52B2Q96RD2 323 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 MACROD1Q9BQ69 325 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 AIG1Q9NVV5 245 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 SH3PXD2BA1X283 911 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 TPST2O60704 377 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 LDB3O75112 727 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 C9P02748 559 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 HTR3AP46098 478 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 ZNF84P51523 738 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 PFN3P60673 137 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 SLC34A1Q06495 639 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 PMS2P3Q13401 168 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 ERV3-1Q14264 604 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 IER5LQ5T953 404 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 TMEM225Q6GV28 225 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 AAGABQ6PD74 315 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 SLITRK4Q8IW52 837 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 APIPQ96GX9 242 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 LRRC3BQ96PB8 259 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 LYRM4Q9HD34 91 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 TMEM45AQ9NWC5 275 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 A0A0G2JPF8 293 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 H0YIV9 168 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 RCBTB2O95199 551 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 BCL6P41182 706 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 CTSKP43235 329 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 MERTKQ12866 999 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 SNAPC1Q16533 368 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 TMEM44Q2T9K0 475 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 UBQLNLQ8IYU4 475 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 OR52P1PQ8NH57 321 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 EBF4Q9BQW3 602 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 EFCAB9A8MZ26 197 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 SEC14L5O43304 696 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 RNF13O43567 381 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 H1F0P07305 194 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 ZNF806P0C7X5 589 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 S100A5P33763 92 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 PGGT1BP53609 377 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 CSNK1G2P78368 415 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 DMTNQ08495 405 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 MEP1AQ16819 746 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 LETMD1Q6P1Q0 360 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 OR7A2PQ8NGA2 310 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 OR8J3Q8NGG0 315 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 OR52J3Q8NH60 311 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 FAM81AQ8TBF8 368 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 UCN3Q969E3 161 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 RFKQ969G6 155 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 PPP1R14AQ96A00 147 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 GRIP2Q9C0E4 1043 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 ADAM30Q9UKF2 790 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 CBLCQ9ULV8 474 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 EDARQ9UNE0 448 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 TESMINQ9Y4I5 508 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 CIB4A0PJX0 185 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 hCG_2039718K7EN88 272 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 KRT36O76013 467 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 HSMCR30P0CW71 290 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 ZNF3P17036 446 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 CD1CP29017 333 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 SOX6P35712 828 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 SH3BP2P78314 561 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 DMPKQ09013 629 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 CSRP2Q16527 193 aa4.85□□□□□ -1.63
PHF3-210ENST00000509876 UGT3A2Q3SY77 523 aa4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms