RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 DMDP11532 3685 aa10.17□□□□□ -0.78
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SH3BP2-209ENST00000504450 BCKDKO14874 412 aa10.16□□□□□ -0.78
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SH3BP2-209ENST00000504450 FRMPD2BQ6IN97 320 aa10.16□□□□□ -0.78
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SH3BP2-209ENST00000504450 SLC5A8Q8N695 610 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 SMYD1Q8NB12 490 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 SETD9Q8NE22 299 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 OR56A1Q8NGH5 318 aa10.16□□□□□ -0.78
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SH3BP2-209ENST00000504450 ELP4Q96EB1 424 aa10.16□□□□□ -0.78
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SH3BP2-209ENST00000504450 USP53Q70EK8 1073 aa10.15□□□□□ -0.78
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