RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SH3BP2-208ENST00000504294 C5orf34Q96MH7 638 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 TSSK3Q96PN8 268 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
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SH3BP2-208ENST00000504294 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 MRGBPQ9NV56 204 aa13.53□□□□□ -0.24
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SH3BP2-208ENST00000504294 ATP6V1HQ9UI12 483 aa13.53□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 ERVK-19Q9WJR5 959 aa13.53□□□□□ -0.24
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SH3BP2-208ENST00000504294 A0A087WV62 115 aa13.52□□□□□ -0.25
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SH3BP2-208ENST00000504294 BEST3Q8N1M1 668 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 ACTRT2Q8TDY3 377 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 STON2Q8WXE9 905 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 ASB15Q8WXK1 588 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 SGCZQ96LD1 299 aa13.52□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 C3orf30Q96M34 536 aa13.52□□□□□ -0.25
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SH3BP2-208ENST00000504294 C3orf14Q9HBI5 128 aa13.52□□□□□ -0.25
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SH3BP2-208ENST00000504294 ACOX3O15254 700 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 SUV39H1O43463 412 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 PLOD3O60568 738 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 ITGA10O75578 1167 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 WDPCPO95876 746 aa13.51□□□□□ -0.25
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SH3BP2-208ENST00000504294 TNFSF10P50591 281 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 MANFP55145 182 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 MLC1Q15049 377 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 GSTA3Q16772 222 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 ANXA8L1Q5VT79 327 aa13.51□□□□□ -0.25
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SH3BP2-208ENST00000504294 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP13.51□□□□□ -0.25
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF843Q8N446 348 aa13.51□□□□□ -0.25
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