RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499038.2

UBE2B-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 682 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-202ENST00000499038 NMUR2Q9GZQ4 415 aa2.59□□□□□ -1.99
UBE2B-202ENST00000499038 MIEF1Q9NQG6 463 aa2.59□□□□□ -1.99
UBE2B-202ENST00000499038 GDF3Q9NR23 364 aa2.59□□□□□ -1.99
UBE2B-202ENST00000499038 DPM3Q9P2X0 92 aa2.59□□□□□ -1.99
UBE2B-202ENST00000499038 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
UBE2B-202ENST00000499038 KLK12Q9UKR0 248 aa2.59□□□□□ -1.99
UBE2B-202ENST00000499038 MEI4A8MW99 385 aa2.58□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 SERF1AO75920 110 aa2.58□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 IGHV3-9P01782 118 aa2.58□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 PVRP15151 417 aa2.58□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 ACP1P24666 158 aa2.58□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 IL2RGP31785 369 aa2.58□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 OR1C1Q15619 314 aa2.58□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 KLHL7Q8IXQ5 586 aa2.58□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa2.58□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 ULK4Q96C45 1275 aa2.58□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 ERO1AQ96HE7 468 aa2.58□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 PRAM1Q96QH2 718 aa2.58□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 S1PR3Q99500 378 aa2.58□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 AGPAT1Q99943 283 aa2.58□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 SLC25A19Q9HC21 320 aa2.58□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 ERVK-19Q9WJR5 959 aa2.58□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 CA5BQ9Y2D0 317 aa2.58□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 ARHGAP23Q9P227 1491 aa2.58□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 KAT6BQ8WYB5 2073 aa2.57□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa2.57□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 NT5C2P49902 561 aa2.57□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 RIPPLY3P57055 190 aa2.57□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 RPS8P62241 208 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 GABPAQ06546 454 aa2.57□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 MS4A13Q5J8X5 152 aa2.57□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 SEL1L2Q5TEA6 688 aa2.57□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 TRAT1Q6PIZ9 186 aa2.57□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 ITIH5Q86UX2 942 aa2.57□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 UXS1Q8NBZ7 420 aa2.57□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 TRPV3Q8NET8 790 aa2.57□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 CCDC26Q8TAB7 109 aa2.57□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 BIRC7Q96CA5 298 aa2.57□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 C19orf43Q9BQ61 176 aa2.57□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 CHD4Q14839 1912 aa2.57□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 LRRK1Q38SD2 2015 aa2.57□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 A0A087X0K7 114 aa2.56□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 TRAV34A0A0B4J273 112 aa2.56□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 TCP11X1B4DZS4 312 aa2.56□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 G3V3Y1 287 aa2.56□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 IDSP22304 550 aa2.56□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 UCP1P25874 307 aa2.56□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 SLC34A1Q06495 639 aa2.56□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 HEPACAMQ14CZ8 416 aa2.56□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 IRGCQ6NXR0 463 aa2.56□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 PODNL1Q6PEZ8 512 aa2.56□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 UNC5CLQ8IV45 518 aa2.56□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 AQP12AQ8IXF9 295 aa2.56□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 THEM5Q8N1Q8 247 aa2.56□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 TRIM9Q9C026 710 aa2.56□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 DNAJC11Q9NVH1 559 aa2.56□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 MIS18AQ9NYP9 233 aa2.56□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa2.56□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 SH3PXD2BA1X283 911 aa2.55□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 PTPN4P29074 926 aa2.55□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 AFF2P51816 1311 aa2.55□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 ZNF131P52739 623 aa2.55□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 DIO3P55073 304 aa2.55□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 LRRC63Q05C16 580 aa2.55□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 HSPA14Q0VDF9 509 aa2.55□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 RALBP1Q15311 655 aa2.55□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 KYAT1Q16773 422 aa2.55□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 TFDP3Q5H9I0 405 aa2.55□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 TAF3Q5VWG9 929 aa2.55□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa2.55□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 GPR65Q8IYL9 337 aa2.55□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 CADM2Q8N3J6 435 aa2.55□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 C9orf85Q96MD7 179 aa2.55□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 ELOVL4Q9GZR5 314 aa2.55□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 SRD5A3Q9H8P0 318 aa2.55□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 CYTL1Q9NRR1 136 aa2.55□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 TEKT2Q9UIF3 430 aa2.55□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa2.55□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 ATG4BQ9Y4P1 393 aa2.55□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa2.55□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 POMT1Q9Y6A1 747 aa2.55□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 GTF3C1Q12789 2109 aa2.54□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 FIBPO43427 364 aa2.54□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 DFNA5O60443 496 aa2.54□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 TSPAN2O60636 221 aa2.54□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 ATP9AO75110 1047 aa2.54□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 CA11O75493 328 aa2.54□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 SLC2A10O95528 541 aa2.54□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 APOA4P06727 396 aa2.54□□□□□ -2
UBE2B-202ENST00000499038 CCDC166P0CW27 439 aa2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms