RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496574.6

PKD1-222, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 4,419 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-222	ENST00000496574	SELENBP1	Q13228	472 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	GPR17	Q13304	367 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574		Q6ZVU0	165 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	OR2T11	Q8NH01	316 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	SLC35B4	Q969S0	331 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	CACNA1S	Q13698	1873 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	ARPC5	O15511	151 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	FAM129C	Q86XR2	697 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	SGCD	Q92629	289 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	TESC	Q96BS2	214 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	PSD2	Q9BQI7	771 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	GLTP	Q9NZD2	209 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	USP3	Q9Y6I4	520 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	MEN1	O00255	615 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	PTGES	O14684	152 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	SSTR2	P30874	369 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	CCL23	P55773	120 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	INHBE	P58166	350 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	BTN1A1	Q13410	526 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	AQP6	Q13520	282 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	KLHL26	Q53HC5	615 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	ELP2	Q6IA86	826 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	SCAMP4	Q969E2	229 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	IL17C	Q9P0M4	197 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	VIPR1	P32241	457 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	RORA	P35398	523 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	MLLT3	P42568	568 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	OR3A2	P47893	321 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	MC1R	Q01726	317 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF91	Q05481	1191 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	FANK1	Q8TC84	345 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF285	Q96NJ3	590 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	DUSP21	Q9H596	190 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	MTMR11	A4FU01	709 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	CARNS1	A5YM72	827 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	C2orf78	A6NCI8	922 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	ALPPL2	P10696	532 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	GTF2F2	P13984	249 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	NDUFV2	P19404	249 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	CD9	P21926	228 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	AGTR1	P30556	359 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	SLC6A6	P31641	620 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	SOX2	P48431	317 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	CTBP2	P56545	445 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	ACTC1	P68032	377 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	ACTA1	P68133	377 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	RIT1	Q92963	219 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	GLOD5	A6NK44	160 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	FXYD1	O00168	92 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	AXIN1	O15169	862 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	UBE2F	Q969M7	185 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	GJD2	Q9UKL4	321 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	CNTRL	Q7Z7A1	2325 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	SOX30	O94993	753 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	ALDOB	P05062	364 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	AMD1	P17707	334 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	PKLR	P30613	574 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF33B	Q06732	778 aa		13.49	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms