RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484178.5

SSBP1-211, Transcript of single stranded DNA binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene SSBP1, Length 676 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1-211ENST00000484178 ANGPTL1O95841 491 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 GOT2P00505 430 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 IFNA14P01570 189 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 PGK2P07205 417 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 LINC00032P0C843 101 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 NR2F1P10589 423 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 ITGA2P17301 1181 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 MATN1P21941 496 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 PCMT1P22061 227 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 DGKAP23743 735 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 IGFBP5P24593 272 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 HRH2P25021 359 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 NFKBIAP25963 317 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 OXTRP30559 389 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 EPHX2P34913 555 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 GGT5P36269 586 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 HPCAL1P37235 193 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 CD86P42081 329 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 CCR10P46092 362 aa4.55□□□□□ -1.68
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SSBP1-211ENST00000484178 GSSP48637 474 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 NDUFV1P49821 464 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 PLK1P53350 603 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 SLC35A2P78381 396 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 MC1RQ01726 317 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 CACNG1Q06432 222 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 CHAF1BQ13112 559 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 TRAF3Q13114 568 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 DYRK1AQ13627 763 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 GRB14Q14449 540 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 GRB7Q14451 532 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 UPP1Q16831 310 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 ZNF404Q494X3 552 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 GGTA1PQ4G0N0 100 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 RUNDC3AQ59EK9 446 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 FAM69AQ5T7M9 428 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 CLEC6AQ6EIG7 209 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 TMEM53Q6P2H8 277 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 XKRXQ6PP77 449 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 CYP20A1Q6UW02 462 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 DLEU7Q6UYE1 221 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 CHST9Q7L1S5 443 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 SZRD1Q7Z422 152 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 HORMAD1Q86X24 394 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 CALHM3Q86XJ0 350 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 KIAA2013Q8IYS2 634 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa4.55□□□□□ -1.68
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SSBP1-211ENST00000484178 OR9I1Q8NGQ6 314 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 GRPEL2Q8TAA5 225 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 ARRDC2Q8TBH0 407 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 DNAJB14Q8TBM8 379 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 METTL6Q8TCB7 284 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 ABHD5Q8WTS1 349 aa4.55□□□□□ -1.68
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SSBP1-211ENST00000484178 ATL1Q8WXF7 558 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 OVCA2Q8WZ82 227 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 SLC38A4Q969I6 547 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 FAM162AQ96A26 154 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 TESCQ96BS2 214 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 PTERQ96BW5 349 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 TMCO6Q96DC7 493 aa4.55□□□□□ -1.68
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SSBP1-211ENST00000484178 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa4.55□□□□□ -1.68
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SSBP1-211ENST00000484178 PSKH2Q96QS6 385 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 SNX18Q96RF0 628 aa4.55□□□□□ -1.68
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SSBP1-211ENST00000484178 PKMYT1Q99640 499 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 PITX2Q99697 317 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 MGME1Q9BQP7 344 aa4.55□□□□□ -1.68
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SSBP1-211ENST00000484178 DPY30Q9C005 99 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 OR2B2Q9GZK3 357 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 TUBB1Q9H4B7 451 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 C3orf14Q9HBI5 128 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 NT5MQ9NPB1 228 aa4.55□□□□□ -1.68
SSBP1-211ENST00000484178 C1orf109Q9NX04 203 aa4.55□□□□□ -1.68
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