RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	AGXT	P21549	392 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	SOX18	P35713	384 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	PLIN5	Q00G26	463 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	DUSP2	Q05923	314 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	GAB1	Q13480	694 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	SELPLG	Q14242	412 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	ADRM1	Q16186	407 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	FHL5	Q5TD97	284 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	COX15	Q7KZN9	410 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	PROSER1	Q86XN7	944 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	WDR54	Q9H977	334 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	APMAP	Q9HDC9	416 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	GIN1	Q9NXP7	522 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	AQP12B	A6NM10	295 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	PCDH17	O14917	1159 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	PLD2	O14939	933 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	NVL	O15381	856 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	B4GALT2	O60909	372 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	LDB3	O75112	727 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	PSMG1	O95456	288 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	RECK	O95980	971 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	S1PR1	P21453	382 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	STT3A	P46977	705 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	MTPN	P58546	118 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	PRR5	P85299	388 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	RHAG	Q02094	409 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	STX4	Q12846	297 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC13A2	Q13183	592 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	MAP7	Q14244	749 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	SYT16	Q17RD7	645 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	LCN8	Q6JVE9	175 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	SHISA5	Q8N114	240 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	OR2T12	Q8NG77	320 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	OR10A6	Q8NH74	314 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	CTRC	Q99895	268 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	NXT1	Q9UKK6	140 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	TTC36	A6NLP5	189 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	UPK1A	O00322	258 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	ASNA1	O43681	348 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	PDE5A	O76074	875 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	NTRK1	P04629	796 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	GGT1	P19440	569 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	SPINK2	P20155	84 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	GPC1	P35052	558 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	MAP3K8	P41279	467 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	BTG2	P78543	158 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	OCA2	Q04671	838 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	FUT7	Q11130	342 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	HSPB3	Q12988	150 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	MTX3	Q5HYI7	312 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	HES3	Q5TGS1	186 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		11.93	□□□□□ -0.5
TRAF4-208	ENST00000469529	DHRS13	Q6UX07	377 aa		11.93	□□□□□ -0.5

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