RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449058.6

TOM1-210, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOM1, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1-210	ENST00000449058	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		16	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		16	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	C12orf66	Q96MD2	445 aa		16	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		16	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		16	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		16	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	OR1A2	Q9Y585	309 aa		16	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	MYO10	Q9HD67	2058 aa		16	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058		H3BN98	237 aa		16	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	MAN2B1	O00754	1011 aa		16	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	UGT2B17	O75795	530 aa		16	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	PCDH8	O95206	1070 aa		16	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	NR2F1	P10589	423 aa		16	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	TEAD1	P28347	426 aa		16	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	SOX6	P35712	828 aa		16	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	TRIM23	P36406	574 aa		16	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	16	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	16	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		16	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		16	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	KRT73	Q86Y46	540 aa		16	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	16	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	TTL	Q8NG68	377 aa		16	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		16	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		16	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	FGF13	Q92913	245 aa		16	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM80	Q96HE8	168 aa		16	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		16	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	WDR26	Q9H7D7	661 aa		16	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		16	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM221	A6NGB7	291 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058		M0R3H8	397 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	MID1	O15344	667 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	PPP2R1B	P30154	601 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	GPC1	P35052	558 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	RAB28	P51157	221 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF91	Q05481	1191 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM64	Q6YI46	380 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	ADCK2	Q7Z695	626 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	TRIM73	Q86UV7	250 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	KLHL31	Q9H511	634 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	XKR8	Q9H6D3	395 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	MED26	O95402	600 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	EPPIN	O95925	133 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	SERPIND1	P05546	499 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	ACP5	P13686	325 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	PKLR	P30613	574 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	15.99	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	KHK	P50053	298 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	HYAL2	Q12891	473 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	IRF4	Q15306	451 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	CCDC190	Q86UF4	302 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	BBS10	Q8TAM1	723 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	KCNK12	Q9HB15	430 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058		A0A075B6Q4	140 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	C4orf51	C9J302	202 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	HAT1	O14929	419 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	CS	O75390	466 aa	Known RBP	15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	SNX4	O95219	450 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	PTTG1	O95997	202 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	DNTT	P04053	509 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	FCAR	P24071	287 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	BCL6	P41182	706 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	SEPHS1	P49903	392 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	FUT5	Q11128	374 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	COX10	Q12887	443 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	SPHAR	Q15513	63 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	CST6	Q15828	149 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	SZRD1	Q7Z422	152 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	CACUL1	Q86Y37	369 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	POC5	Q8NA72	575 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	OBP2A	Q9NY56	170 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	CKAP5	Q14008	2032 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	CKMT1A	P12532	417 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	MMP11	P24347	488 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	NTS	P30990	170 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	FGL2	Q14314	439 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	GPR19	Q15760	415 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	NDUFA9	Q16795	377 aa		15.98	■□□□□ 0.15

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