RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448188.1

SNORD57-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 57, humanhuman

BASIC

Gene SNORD57, Length 72 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleolus, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD57-201ENST00000448188 HCKP08631 526 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 PIRTP0C851 137 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 RRASP10301 218 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 ESDP10768 282 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 FOLR1P15328 257 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 NPR1P16066 1061 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 ATP2B1P20020 1258 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 GPX3P22352 226 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 LRPAP1P30533 357 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 TTKP33981 857 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 RYKP34925 604 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 BMI1P35226 326 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 BSGP35613 385 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 ACVR1BP36896 505 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 ETV5P41161 510 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 GABRB2P47870 512 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 MMP14P50281 582 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 CLCNKAP51800 687 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 TERF1P54274 439 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 TIRAPP58753 221 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 ECT2LQ008S8 904 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 IL1RL1Q01638 556 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 FCHO2Q0JRZ9 810 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 MAMLD1Q13495 774 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 ITGA7Q13683 1181 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 COG2Q14746 738 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 CHRNA6Q15825 494 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 Q1RN00 199 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 PLPPR5Q32ZL2 321 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 USP41Q3LFD5 358 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 WDR45BQ5MNZ6 344 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 CERCAMQ5T4B2 595 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 PRR9Q5T870 116 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 WDR78Q5VTH9 848 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 ANKRD22Q5VYY1 191 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 C1orf228Q6PIY5 440 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 HRCT1Q6UXD1 115 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 ZNF621Q6ZSS3 439 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 TPRG1Q6ZUI0 275 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 SYVN1Q86TM6 617 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 LINC00596Q86U02 117 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 CCDC25Q86WR0 208 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 FAM90A1Q86YD7 464 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 MSRB3Q8IXL7 192 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 NIM1KQ8IY84 436 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 RDH10Q8IZV5 341 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 CENPSQ8N2Z9 138 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 MTURNQ8N3F0 131 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 DPP10Q8N608 796 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 MYCT1Q8N699 235 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 ATG16L2Q8NAA4 619 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 TMEM116Q8NCL8 245 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 OR52N4Q8NGI2 321 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 OR4D11Q8NGI4 311 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 NANPQ8TBE9 248 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 C7orf33Q8WU49 177 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 FAR1Q8WVX9 515 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 JADE3Q92613 823 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 KCNJ9Q92806 393 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 DNASE1L2Q92874 299 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 ZBTB10Q96DT7 871 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 CCDC51Q96ER9 411 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 CDCA5Q96FF9 252 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 SCRN2Q96FV2 425 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 CLPTM1LQ96KA5 538 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 SMC6Q96SB8 1091 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 STACQ99469 402 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 TXN2Q99757 166 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 PAAF1Q9BRP4 392 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 NICN1Q9BSH3 213 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 HGH1Q9BTY7 390 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 SRXN1Q9BYN0 137 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 KRT23Q9C075 422 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 VCXQ9H320 206 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 TMX1Q9H3N1 280 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 ARMT1Q9H993 441 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 FKRPQ9H9S5 495 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 PCDH12Q9NPG4 1184 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 TBC1D23Q9NUY8 699 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 DPP3Q9NY33 737 aa-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 B3GAT1Q9P2W7 334 aa-0.84□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms