RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447232.6

PMS1-215, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PMS1, Length 2,576 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-215ENST00000447232 ARL5AQ9Y689 179 aa2.91□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP2.91□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 A8MUA0 341 aa2.9□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 M0QZ24 198 aa2.9□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 EMC8O43402 210 aa2.9□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 KIF5CO60282 957 aa2.9□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 RNF8O76064 485 aa2.9□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 ACTL6AO96019 429 aa2.9□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 ERGP11308 486 aa2.9□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 TPSB2P20231 275 aa2.9□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 PCMT1P22061 227 aa2.9□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 KCNJ5P48544 419 aa2.9□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 EFNA4P52798 201 aa2.9□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 CDH15P55291 814 aa2.9□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 FUT7Q11130 342 aa2.9□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 MAMLD1Q13495 774 aa2.9□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 GUSBP1Q15486 140 aa2.9□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 TPSAB1Q15661 275 aa2.9□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 SLC1A5Q15758 541 aa2.9□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 FXNQ16595 210 aa2.9□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 GPR33Q49SQ1 333 aa2.9□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 EIPR1Q53HC9 387 aa2.9□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 BOLA3Q53S33 107 aa2.9□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 PRAMEF20Q5VT98 475 aa2.9□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 FNDC7Q5VTL7 733 aa2.9□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 AGAP6Q5VW22 663 aa2.9□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa2.9□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 SCIMPQ6UWF3 145 aa2.9□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 SYT14Q8NB59 555 aa2.9□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 SLC16A11Q8NCK7 471 aa2.9□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 C3orf49Q96BT1 292 aa2.9□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 KRT12Q99456 494 aa2.9□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 C19orf43Q9BQ61 176 aa2.9□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 CCDC77Q9BR77 488 aa2.9□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 PIMREGQ9BSJ6 248 aa2.9□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 SUCNR1Q9BXA5 334 aa2.9□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 FAM96AQ9H5X1 160 aa2.9□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 ANKHQ9HCJ1 492 aa2.9□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 MYO1AQ9UBC5 1043 aa2.9□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 PCYOX1Q9UHG3 505 aa2.9□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa2.9□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 SLC22A7Q9Y694 548 aa2.9□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 PRSS21Q9Y6M0 314 aa2.9□□□□□ -1.94
PMS1-215ENST00000447232 EXPH5Q8NEV8 1989 aa2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 KRT87PA6NCN2 255 aa2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 TMEM191CA6NGB0 347 aa2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 ZNF860A6NHJ4 632 aa2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 SHISA9B4DS77 424 aa2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 GOLGA8MH3BSY2 632 aa2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 GFYI3L273 518 aa2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 HAT1O14929 419 aa2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 CYP7B1O75881 506 aa2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 LY6HO94772 140 aa2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 ACSL3O95573 720 aa2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 FSHBP01225 129 aa2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 FESP07332 822 aa2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 RBP3P10745 1247 aa2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 ITGALP20701 1170 aa2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 PTNP21246 168 aa2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 IL2RGP31785 369 aa2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 WNT3AP56704 352 aa2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 GBE1Q04446 702 aa2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 PNOCQ13519 176 aa2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 CCSMST1Q4G0I0 132 aa2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 CCDC122Q5T0U0 273 aa2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 MICALCLQ6ZW33 695 aa2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 OR8K3Q8NH51 312 aa2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 RAD51AP1Q96B01 352 aa2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 TM4SF19Q96DZ7 209 aa2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 CITED1Q99966 193 aa2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 MACROD1Q9BQ69 325 aa2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 ACAT2Q9BWD1 397 aa2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 JAM3Q9BX67 310 aa2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 STK33Q9BYT3 514 aa2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 CBLN4Q9NTU7 201 aa2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 ASH2LQ9UBL3 628 aa2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 HEY2Q9UBP5 337 aa2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 MAN1B1Q9UKM7 699 aa2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa2.9□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 LRP5LA4QPB2 252 aa2.89□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa2.89□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 G3V4G9 280 aa2.89□□□□□ -1.95
PMS1-215ENST00000447232 H0Y3Z8 333 aa2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms