RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446688.5

TNS1-209, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 4,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-209ENST00000446688 HSDL2Q6YN16 418 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 ASB18Q6ZVZ8 466 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 ZNF676Q8N7Q3 588 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 PTCHD1Q96NR3 888 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 ATOH8Q96SQ7 321 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 COMMD4Q9H0A8 199 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 MGAT4BQ9UQ53 548 aa9.55□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 FAM170BA6NMN3 283 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 PPP6CO00743 305 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 SLC19A2O60779 497 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 ENTPD6O75354 484 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 MSL3P1P0C860 447 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 JUNDP17535 347 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 ACVR2AP27037 513 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 TNFSF8P32971 234 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 GGT2P36268 569 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 DDOSTP39656 456 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 HTR6P50406 440 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 GP2P55259 537 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 ISL1P61371 349 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 CST9Q5W186 159 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 REEP3Q6NUK4 255 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 TBPL2Q6SJ96 375 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 NRARPQ7Z6K4 114 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 IQCF2Q8IXL9 164 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 OR4K17Q8NGC6 315 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 ZFP3Q96NJ6 502 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 NECTIN4Q96NY8 510 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 TRIB3Q96RU7 358 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 TPSD1Q9BZJ3 242 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 HOXD1Q9GZZ0 328 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 KLRF1Q9NZS2 232 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 ABCG2Q9UNQ0 655 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 USP3Q9Y6I4 520 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 RTCAO00442 366 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 S100GP29377 79 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 TBPL1P62380 186 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 RPA4Q13156 261 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 LRIT3Q3SXY7 679 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 ZNF583Q96ND8 569 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 F2RL3Q96RI0 385 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 BOCQ9BWV1 1114 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 TCF7L1Q9HCS4 588 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 CD93Q9NPY3 652 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 SDHAF3Q9NRP4 125 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 MED11Q9P086 117 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 SLAMF8Q9P0V8 285 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 OR1A2Q9Y585 309 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 SPO11Q9Y5K1 396 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 KLK4Q9Y5K2 254 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 NOX1Q9Y5S8 564 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 A0A0U1RQS6 177 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 OR6C74A6NCV1 312 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 C2orf74A8MZ97 194 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 B8ZZF3 427 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 ICMTO60725 284 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 ARHGEF15O94989 841 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 RCBTB2O95199 551 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 SOX14O95416 240 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 PLGP00747 810 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 HRH2P25021 359 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 UQCRC1P31930 480 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 ZNF81P51508 661 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 RBBP4Q09028 425 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 USP51Q70EK9 711 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 TOMM5Q8N4H5 51 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 KLHL36Q8N4N3 616 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 SPERTQ8NA61 448 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 OR5H6Q8NGV6 325 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP9.54□□□□□ -0.881e-8■■■■■ 56.6
TNS1-209ENST00000446688 NKD1Q969G9 470 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 FAM129BQ96TA1 746 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 SEC61A2Q9H9S3 476 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 MCCC2Q9HCC0 563 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 HCSTQ9UBK5 93 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 KLF15Q9UIH9 416 aa9.54□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 OR5K4A6NMS3 321 aa9.53□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 ANXA2P2A6NMY6 339 aa9.53□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 LATO43561 262 aa9.53□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 RAB36O95755 333 aa9.53□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 ARSAP15289 507 aa9.53□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 GSTM3P21266 225 aa9.53□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 CASRP41180 1078 aa9.53□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 MAZP56270 477 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 WDR5P61964 334 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
TNS1-209ENST00000446688 KCNC4Q03721 635 aa9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms