RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444658.7

CCNDBP1-202, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,479 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-202ENST00000444658 RNF130Q86XS8 419 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 GPR135Q8IZ08 494 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 EID2Q8N6I1 236 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR9A4Q8NGU2 314 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 RASSF5Q8WWW0 418 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 CTHRC1Q96CG8 243 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 PRRX2Q99811 253 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 COQ10BQ9H8M1 238 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 FANCEQ9HB96 536 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 IL1RAPQ9NPH3 570 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 ADPRHL2Q9NX46 363 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 C5AR2Q9P296 337 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 LIPT1Q9Y234 373 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 SNX8Q9Y5X2 465 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 AP4B1Q9Y6B7 739 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 CPED1A4D0V7 1026 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 GLOD5A6NK44 160 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 SGK494L7N484 410 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 HMGN4O00479 90 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 CLOCKO15516 846 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 FLRT2O43155 660 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 B4GALT2O60909 372 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 DNAJB6O75190 326 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP8.68□□□□□ -1.02
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CCNDBP1-202ENST00000444658 PRKD3O94806 890 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 SERPINA1P01009 418 aa8.68□□□□□ -1.02
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CCNDBP1-202ENST00000444658 HBQ1P09105 142 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF806P0C7X5 589 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 ETFAP13804 333 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 ETS2P15036 469 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 MATN1P21941 496 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 FEN1P39748 380 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 MAN2A2P49641 1150 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 CDK9P50750 372 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 CHN2P52757 468 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 CCL7P80098 99 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 HSPB3Q12988 150 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 TP53BP2Q13625 1128 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 SCARB2Q14108 478 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 SERTAD2Q14140 314 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 GK3PQ14409 553 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 PDK3Q15120 406 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 SPDYE7PQ495Y7 208 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF628Q5EBL2 1059 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 PERM1Q5SV97 790 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM154Q6P9G4 183 aa8.68□□□□□ -1.02
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CCNDBP1-202ENST00000444658 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 LGI4Q8N135 537 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 LZICQ8WZA0 190 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 FKBP10Q96AY3 582 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 RDH12Q96NR8 316 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 DOHHQ9BU89 302 aa8.68□□□□□ -1.02
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CCNDBP1-202ENST00000444658 BTBD2Q9BX70 525 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 TGIF2Q9GZN2 237 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 STARD5Q9NSY2 213 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 CUTCQ9NTM9 273 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 CALML5Q9NZT1 146 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 DNAJB9Q9UBS3 223 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 SRPK3Q9UPE1 567 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 CLCA2Q9UQC9 943 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 MMACHCQ9Y4U1 282 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 SPAG17Q6Q759 2223 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 THADAQ6YHU6 1953 aa8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 CACNA1EQ15878 2313 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 KNL1Q8NG31 2342 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 CEP192Q8TEP8 1941 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 A0A0G2JPF8 293 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 BDP1A6H8Y1 2624 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 TTC36A6NLP5 189 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM150CB9EJG8 249 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 I3L1I5 382 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 UPK1AO00322 258 aa8.67□□□□□ -1.02
CCNDBP1-202ENST00000444658 DSCR3O14972 297 aa8.67□□□□□ -1.02
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