RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 SLC22A16Q86VW1 577 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 KIF2BQ8N4N8 673 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 CCNYL1Q8N7R7 359 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 ACOT4Q8N9L9 421 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 B3GNT7Q8NFL0 401 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 OR4F6Q8NGB9 312 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 RGMAQ96B86 450 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 VMP1Q96GC9 406 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 QRFPRQ96P65 431 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 TMEM237Q96Q45 408 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 TBCDQ9BTW9 1192 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 ELOVL6Q9H5J4 265 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 ZBTB26Q9HCK0 441 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 NECTIN3Q9NQS3 549 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 MMACHCQ9Y4U1 282 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 SPACA6W5XKT8 324 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 HCFC1P51610 2035 aa10.83□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 A8MVJ9 347 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 H0YIV9 168 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 PPP6CO00743 305 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 CLDN4O14493 209 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 BIRC5O15392 142 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 ITGA10O75578 1167 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 OTCP00480 354 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 IFNA16P05015 189 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 CPN2P22792 545 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 DNASE1P24855 282 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 ACVR2AP27037 513 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 PIK3CBP42338 1070 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 HERVK_113P63132 956 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 CLCQ05315 142 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 PCDH1Q08174 1060 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 TRAF3Q13114 568 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 SLAMF1Q13291 335 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 E2F2Q14209 437 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 CHI3L2Q15782 390 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 LIPMQ5VYY2 423 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 FAM219BQ5XKK7 198 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 OR4C11Q6IEV9 310 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 GK5Q6ZS86 529 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 UBE3DQ7Z6J8 389 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 SLC22A9Q8IVM8 553 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 TRIM42Q8IWZ5 723 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 MMP21Q8N119 569 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 MARVELD2Q8N4S9 558 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 L3MBTL4Q8NA19 623 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 TMEM52Q8NDY8 209 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 LRRC8CQ8TDW0 803 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 CKAP2Q8WWK9 683 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 CCDC126Q96EE4 140 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 MAGEB18Q96M61 343 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 ERVK-6Q9BXR3 956 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 PRDM7Q9NQW5 492 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 HPF1Q9NWY4 346 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 B4GALT7Q9UBV7 327 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 DAPP1Q9UN19 280 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 DNHD1Q96M86 4753 aa10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 PLPP1O14494 284 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 TRIM13O60858 407 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 WDR1O75083 606 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 ZFAND5O76080 213 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 MYO1DO94832 1006 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 OR4F21O95013 312 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 ETHE1O95571 254 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 GBAP04062 536 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 KLK2P20151 261 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 NUP107P57740 925 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 ID2Q02363 134 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 ASPHQ12797 758 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 STX4Q12846 297 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 UNC50Q53HI1 259 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 ZNF678Q5SXM1 525 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 DEPDC1Q5TB30 811 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 FRG2Q64ET8 278 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 LETMD1Q6P1Q0 360 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 CYP20A1Q6UW02 462 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 CAMKMTQ7Z624 323 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 ZNF227Q86WZ6 799 aa10.81□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
PRAME-210ENST00000442481 CDYL2Q8N8U2 506 aa10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.3 ms