RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa12.77□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 CXorf21Q9HAI6 301 aa12.77□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 SACM1LQ9NTJ5 587 aa12.77□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 AHSPQ9NZD4 102 aa12.77□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 FETUBQ9UGM5 382 aa12.77□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 ADAM29Q9UKF5 820 aa12.77□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 DTX4Q9Y2E6 619 aa12.77□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa12.77□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 HRH3Q9Y5N1 445 aa12.77□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 PCNX3Q9H6A9 2034 aa12.77□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 CSMD1Q96PZ7 3565 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 LRBAP50851 2863 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 G3V2L1 256 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 PRRG2O14669 202 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 ADAM10O14672 748 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 GLRA3O75311 464 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 P04436 131 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 GSTA1P08263 222 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 CPMP14384 443 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 KRT15P19012 456 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 CNR1P21554 472 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 PTGS2P35354 604 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 RAE1P78406 368 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 BTKQ06187 659 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 BIKQ13323 160 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 LTB4RQ15722 352 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 NNATQ16517 81 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 SLC48A1Q6P1K1 146 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 FAM111BQ6SJ93 734 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 GK5Q6ZS86 529 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 SH2D5Q6ZV89 423 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 SLC22A9Q8IVM8 553 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 PRR22Q8IZ63 422 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 C4orf33Q8N1A6 199 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 TMEM251Q8N6I4 163 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 GOLM1Q8NBJ4 401 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 MYRIPQ8NFW9 859 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 OR10G3Q8NGC4 313 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 OR4K14Q8NGD5 310 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 OR2W6PQ8NHA6 318 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 FAM57AQ8TBR7 257 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 METTL6Q8TCB7 284 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 ACMSDQ8TDX5 336 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 KLHL29Q96CT2 875 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 L3HYPDHQ96EM0 354 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 APIPQ96GX9 242 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 FAM173AQ9BQD7 235 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 EBPLQ9BY08 206 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 BRF2Q9HAW0 419 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 HEY2Q9UBP5 337 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 CES1P1Q9UKY3 287 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 C1orf226A1L170 272 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 C19orf84I3L1E1 186 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 ACOT7O00154 380 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 ATP6AP2O75787 350 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 GLSO94925 669 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 ESRRBO95718 433 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 KRT6AP02538 564 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 PROCP04070 461 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 KRT6BP04259 564 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 IL3P08700 152 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 MYL2P10916 166 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 PRF1P14222 555 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 GALNSP34059 522 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 SOX18P35713 384 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 KRT6CP48668 564 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 FOXO1Q12778 655 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 LCP2Q13094 533 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 DUSP8Q13202 625 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 BICRALQ6AI39 1079 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 MTFR2Q6P444 385 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 ZYG11AQ6WRX3 759 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 RPTNQ6XPR3 784 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 LCA5Q86VQ0 697 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 MARVELD2Q8N4S9 558 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 ZNF615Q8N8J6 731 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 ZNF441Q8N8Z8 693 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 ADCY4Q8NFM4 1077 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 CHTF18Q8WVB6 975 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 SGCZQ96LD1 299 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 DMRTA2Q96SC8 542 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 BRINP2Q9C0B6 783 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 OR10A5Q9H207 317 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 PROK2Q9HC23 129 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 SH2D2AQ9NP31 389 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 MID1IP1Q9NPA3 183 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 PLSCR2Q9NRY7 297 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP12.75□□□□□ -0.37
PRAME-209ENST00000439106 VPS29Q9UBQ0 182 aa12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.1 ms