RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP13.85□□□□□ -0.19
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PTPRU-204ENST00000428026 DCKP27707 260 aa13.85□□□□□ -0.19
PTPRU-204ENST00000428026 PTPN6P29350 595 aa13.85□□□□□ -0.19
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PTPRU-204ENST00000428026 COQ10AQ96MF6 247 aa13.84□□□□□ -0.19
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PTPRU-204ENST00000428026 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP13.84□□□□□ -0.19
PTPRU-204ENST00000428026 SNAPC5O75971 98 aa13.84□□□□□ -0.19
PTPRU-204ENST00000428026 CDKN2CP42773 168 aa13.84□□□□□ -0.19
PTPRU-204ENST00000428026 CHRFAM7AQ494W8 412 aa13.84□□□□□ -0.19
PTPRU-204ENST00000428026 NETO1Q8TDF5 533 aa13.84□□□□□ -0.19
PTPRU-204ENST00000428026 IRF7Q92985 503 aa13.84□□□□□ -0.19
PTPRU-204ENST00000428026 TMEM181Q9P2C4 612 aa13.84□□□□□ -0.19
PTPRU-204ENST00000428026 CEPT1Q9Y6K0 416 aa13.84□□□□□ -0.19
PTPRU-204ENST00000428026 GOSR2O14653 212 aa13.84□□□□□ -0.19
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