RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 TNFSF13O75888 250 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 CD22P20273 847 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 PLIN5Q00G26 463 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 DMTNQ08495 405 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 DOC2AQ14183 400 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 FBXO48Q5FWF7 155 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM158Q8WZ71 300 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM41AQ96HV5 264 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 UCN2Q96RP3 112 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 MS4A8Q9BY19 250 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 GPRC5BQ9NZH0 403 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 SONP18583 2426 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 WASHC1A8K0Z3 465 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 CAPN14A8MX76 684 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 H0Y3Z8 333 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 TAPBPO15533 448 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 SOX30O94993 753 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 SCELO95171 688 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF75DP51815 510 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 SLAMF1Q13291 335 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 GAB1Q13480 694 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF460Q14592 562 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 TSNQ15631 228 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 SPRED3Q2MJR0 410 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 C18orf63Q68DL7 685 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 TIGD3Q6B0B8 471 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 GALNT7Q86SF2 657 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 ESAMQ96AP7 390 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM79Q9BSE2 394 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 MED18Q9BUE0 208 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 CAPS2Q9BXY5 557 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 CLCF1Q9UBD9 225 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXD12-201ENST00000404162 A0A087X1B8 175 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1W2PNV4 684 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 OR6C76A6NM76 312 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 SAP18O00422 153 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 MSTNO14793 375 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 CLGNO14967 610 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 IFNA2P01563 188 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 PAX1P15863 534 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 PCDH1Q08174 1060 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 BIKQ13323 160 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 AP5B1Q2VPB7 878 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 SPANXN3Q5MJ09 141 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 FRA10AC1Q70Z53 315 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF550Q7Z398 422 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 PRR22Q8IZ63 422 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 MEIOBQ8N635 442 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 OR1J4Q8NGS1 313 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 ANKRD49Q8WVL7 239 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 ANKRD7Q92527 254 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 TANKQ92844 425 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 TP53INP1Q96A56 240 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 CERS2Q96G23 380 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 ACBD3Q9H3P7 528 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 EHD1Q9H4M9 534 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 SNX15Q9NRS6 342 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 DNAJC11Q9NVH1 559 aa17.51■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 EXPH5Q8NEV8 1989 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 C2orf72A6NCS6 295 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP17.5■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 TGFB1P01137 390 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 SSTR4P31391 388 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 CCKARP32238 428 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 CXCR5P32302 372 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 CD79BP40259 229 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 SSR2P43308 183 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 STARP49675 285 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 DESI1Q6ICB0 168 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 C22orf34Q6ZV56 151 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 TRIM42Q8IWZ5 723 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 RIT1Q92963 219 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 CTHRC1Q96CG8 243 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 STARD4Q96DR4 205 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 WDR34Q96EX3 536 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXD12-201ENST00000404162 FAM111AQ96PZ2 611 aa17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96.4 ms