RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376959.6

KCNC3-201, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene KCNC3, Length 5,447 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3-201ENST00000376959 BEST4Q8NFU0 473 aa21.36■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa21.36■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 NEURL4Q96JN8 1562 aa21.36■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 TRAPPC13A5PLN9 417 aa21.36■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 C11orf98E9PRG8 122 aa21.36■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 H3BMQ9 156 aa21.36■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 BEST1O76090 585 aa21.36■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 TFP02787 698 aa21.36■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 HOXD12P35452 270 aa21.36■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 MTNR1AP48039 350 aa21.36■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 RCAN2Q14206 197 aa21.36■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 PPA1Q15181 289 aa21.36■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 CFAP77Q6ZQR2 320 aa21.36■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 TEX26Q8N6G2 289 aa21.36■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 COG8Q96MW5 612 aa21.36■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa21.36■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 PHYHO14832 338 aa21.35■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 EMC8O43402 210 aa21.35■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 RETP07949 1114 aa21.35■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 IFNGR1P15260 489 aa21.35■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 PRKCAP17252 672 aa21.35■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 NR4A2P43354 598 aa21.35■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 BCL2A1Q16548 175 aa21.35■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa21.35■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 SLC16A8O95907 504 aa21.35■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 RAB4BP61018 213 aa21.35■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 PLP2Q04941 152 aa21.35■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 ZNF674Q2M3X9 581 aa21.35■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 MLIPQ5VWP3 458 aa21.35■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 CCDC116Q8IYX3 515 aa21.35■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 ZFP41Q8N8Y5 198 aa21.35■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 OR56B2PQ8NGI1 322 aa21.35■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 OR13C3Q8NGS6 347 aa21.35■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 PEBP4Q96S96 227 aa21.35■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 TMEM181Q9P2C4 612 aa21.35■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 KLHL21Q9UJP4 597 aa21.35■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 YIPF1Q9Y548 306 aa21.35■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 A0A1W2PRU2 124 aa21.35■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 ARPC5O15511 151 aa21.35■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 PRAF2O60831 178 aa21.35■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 DNAJB6O75190 326 aa21.35■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 NFAT5O94916 1531 aa21.35■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 F5H5P2 479 aa21.35■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 KCNQ1P51787 676 aa21.35■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 RIDAP52758 137 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 DCAF4L2Q8NA75 395 aa21.35■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 DENND1AQ8TEH3 1009 aa21.35■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 FEVQ99581 238 aa21.35■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 SLC28A3Q9HAS3 691 aa21.35■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 CERS1P27544 350 aa21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 CTHP32929 405 aa21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 FGL2Q14314 439 aa21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 UGT3A2Q3SY77 523 aa21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 ENPP6Q6UWR7 440 aa21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 SYT14Q8NB59 555 aa21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 GLYATL2Q8WU03 294 aa21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 PLAGL1Q9UM63 463 aa21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 CYP8B1Q9UNU6 501 aa21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 ICKQ9UPZ9 632 aa21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 NAP1L6A6NFF2 107 aa21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 CSTAP01040 98 aa21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 FHP07954 510 aa21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 PREPP48147 710 aa21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 ERVK-25P63136 954 aa21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 KBTBD6Q86V97 674 aa21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 TRAM1L1Q8N609 369 aa21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 NUP43Q8NFH3 380 aa21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 OR5M3Q8NGP4 307 aa21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 ZNF175Q9Y473 711 aa21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 SPDEFO95238 335 aa21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 MPC1LP0DKB6 136 aa21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 DRD5P21918 477 aa21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 PTPN6P29350 595 aa21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 C22orf39Q6P5X5 142 aa21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 C3orf58Q8NDZ4 430 aa21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 OR14A2Q96R54 314 aa21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 DKKL1Q9UK85 242 aa21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 A6NHS1 94 aa21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 NFATC2Q13469 925 aa21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 LRFN4Q6PJG9 635 aa21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 MAS1P04201 325 aa21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 MAOAP21397 527 aa21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 ZNF84P51523 738 aa21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 TMEM225Q6GV28 225 aa21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 DESI1Q6ICB0 168 aa21.34■■□□□ 1.01
KCNC3-201ENST00000376959 WDR20Q8TBZ3 569 aa21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms