RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362076.8

C1orf43-202, Transcript of chromosome 1 open reading frame 43, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C1orf43, Length 1,551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf43-202ENST00000362076 ATP1B1P05026 303 aa15.03■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 MSL3P1P0C860 447 aa15.03■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 AVPR1BP47901 424 aa15.03■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 CRYBA2P53672 197 aa15.03■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 CRISP3P54108 245 aa15.03■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 ARSFP54793 590 aa15.03■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 RPS26P62854 115 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 OLR1P78380 273 aa15.03■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 DUSP2Q05923 314 aa15.03■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 DAG1Q14118 895 aa15.03■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 PDK3Q15120 406 aa15.03■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 ZNF750Q32MQ0 723 aa15.03■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 NHSL2Q5HYW2 709 aa15.03■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 NKAIN2Q5VXU1 208 aa15.03■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 PRSS41Q7RTY9 318 aa15.03■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 VTCN1Q7Z7D3 282 aa15.03■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 KRT73Q86Y46 540 aa15.03■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 LGI4Q8N135 537 aa15.03■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 TAMM41Q96BW9 452 aa15.03■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 TMEM19Q96HH6 336 aa15.03■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 ACTRT3Q9BYD9 372 aa15.03■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 BCL2L10Q9HD36 194 aa15.03■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 IRAK4Q9NWZ3 460 aa15.03■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 CALML5Q9NZT1 146 aa15.03■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 PCDH15Q96QU1 1955 aa15.03■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 UNC13CQ8NB66 2214 aa15.03■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 A0A087WV62 115 aa15.02■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 H0YIG0 161 aa15.02■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 CHST10O43529 356 aa15.02■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 SLC28A2O43868 658 aa15.02■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 SOX30O94993 753 aa15.02■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 PGM3O95394 542 aa15.02■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 BCHEP06276 602 aa15.02■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 OR12D1P0DN82 309 aa15.02■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 NR2F1P10589 423 aa15.02■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 CD1CP29017 333 aa15.02■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 MC3RP41968 323 aa15.02■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 PRKAG1P54619 331 aa15.02■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 SHC2P98077 582 aa15.02■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 GK3PQ14409 553 aa15.02■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 GPR19Q15760 415 aa15.02■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 AMZ1Q400G9 498 aa15.02■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 C6orf52Q5T4I8 152 aa15.02■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 GALNT10Q86SR1 603 aa15.02■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 STK32CQ86UX6 486 aa15.02■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 ZNF595Q8IYB9 648 aa15.02■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 OR2L13Q8N349 312 aa15.02■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 D2HGDHQ8N465 521 aa15.02■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 OR9A4Q8NGU2 314 aa15.02■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 BBS10Q8TAM1 723 aa15.02■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 XAGE5Q8WWM1 108 aa15.02■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 TFAP2CQ92754 450 aa15.02■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 C7orf34Q96L11 122 aa15.02■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 MS4A4EQ96PG1 132 aa15.02■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 THSD1Q9NS62 852 aa15.02■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 USE1Q9NZ43 259 aa15.02■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 RAB23Q9ULC3 237 aa15.02■□□□□ -0
C1orf43-202ENST00000362076 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa15.02□□□□□ -0.01
C1orf43-202ENST00000362076 CLDN4O14493 209 aa15.02□□□□□ -0.01
C1orf43-202ENST00000362076 ADAMDEC1O15204 470 aa15.02□□□□□ -0.01
C1orf43-202ENST00000362076 DNAJB6O75190 326 aa15.02□□□□□ -0.01
C1orf43-202ENST00000362076 RDH16O75452 317 aa15.02□□□□□ -0.01
C1orf43-202ENST00000362076 CER1O95813 267 aa15.02□□□□□ -0.01
C1orf43-202ENST00000362076 CFIP05156 583 aa15.02□□□□□ -0.01
C1orf43-202ENST00000362076 ETS2P15036 469 aa15.02□□□□□ -0.01
C1orf43-202ENST00000362076 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
C1orf43-202ENST00000362076 DCTP40126 519 aa15.02□□□□□ -0.01
C1orf43-202ENST00000362076 ITGA1P56199 1179 aa15.02□□□□□ -0.01
C1orf43-202ENST00000362076 VLDLRP98155 873 aa15.02□□□□□ -0.01
C1orf43-202ENST00000362076 MERTKQ12866 999 aa15.02□□□□□ -0.01
C1orf43-202ENST00000362076 BIKQ13323 160 aa15.02□□□□□ -0.01
C1orf43-202ENST00000362076 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
C1orf43-202ENST00000362076 RFX4Q33E94 735 aa15.02□□□□□ -0.01
C1orf43-202ENST00000362076 ATAD3BQ5T9A4 648 aa15.02□□□□□ -0.01
C1orf43-202ENST00000362076 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
C1orf43-202ENST00000362076 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa15.02□□□□□ -0.01
C1orf43-202ENST00000362076 TMEM105Q8N8V8 129 aa15.02□□□□□ -0.01
C1orf43-202ENST00000362076 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
C1orf43-202ENST00000362076 C7orf57Q8NEG2 295 aa15.02□□□□□ -0.01
C1orf43-202ENST00000362076 OR5T3Q8NGG3 340 aa15.02□□□□□ -0.01
C1orf43-202ENST00000362076 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa15.02□□□□□ -0.01
C1orf43-202ENST00000362076 SPPL2AQ8TCT8 520 aa15.02□□□□□ -0.01
C1orf43-202ENST00000362076 ZNF675Q8TD23 568 aa15.02□□□□□ -0.01
C1orf43-202ENST00000362076 RAB8BQ92930 207 aa15.02□□□□□ -0.01
C1orf43-202ENST00000362076 COL26A1Q96A83 441 aa15.02□□□□□ -0.01
C1orf43-202ENST00000362076 MVB12AQ96EY5 273 aa15.02□□□□□ -0.01
C1orf43-202ENST00000362076 MAGED4Q96JG8 741 aa15.02□□□□□ -0.01
C1orf43-202ENST00000362076 DPYSL5Q9BPU6 564 aa15.02□□□□□ -0.01
C1orf43-202ENST00000362076 BTBD2Q9BX70 525 aa15.02□□□□□ -0.01
C1orf43-202ENST00000362076 SERHL2Q9H4I8 314 aa15.02□□□□□ -0.01
C1orf43-202ENST00000362076 REEP1Q9H902 201 aa15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms