RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356384.4

RXRA-201, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RXRA, Length 5,770 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-201ENST00000356384 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa15.37■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 SLC11A1P49279 550 aa15.37■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 RIDAP52758 137 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 FOXK1P85037 733 aa15.37■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 C6orf141Q5SZD1 244 aa15.37■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa15.37■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 FAM46BQ96A09 425 aa15.37■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 ZDHHC12Q96GR4 267 aa15.37■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 NELL2Q99435 816 aa15.37■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 LEFTY1O75610 366 aa15.37■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 ATE1O95260 518 aa15.37■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 IFNA10P01566 189 aa15.37■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 GPR143P51810 404 aa15.37■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 MALLQ13021 153 aa15.37■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 DEFB134Q4QY38 66 aa15.37■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 OR52P1PQ8NH57 321 aa15.37■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 CPT1CQ8TCG5 803 aa15.37■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 SCAMP4Q969E2 229 aa15.37■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 ERVK13-1Q9NX77 482 aa15.37■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 OR6C6A6NF89 314 aa15.37■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 EMC8O43402 210 aa15.37■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 PRKXP51817 358 aa15.37■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 GRB7Q14451 532 aa15.37■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 IGDCC3Q8IVU1 814 aa15.37■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa15.37■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa15.37■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 STSP08842 583 aa15.37■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 AKR1C2P52895 323 aa15.37■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 ELOCQ15369 112 aa15.37■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 NTRK2Q16620 822 aa15.37■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa15.37■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 MARVELD2Q8N4S9 558 aa15.37■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 PITX2Q99697 317 aa15.37■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 POPDC3Q9HBV1 291 aa15.37■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa15.37■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 RASAL1O95294 804 aa15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 FBLP22087 321 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 RNF111Q6ZNA4 994 aa15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 RCBTB1Q8NDN9 531 aa15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 OR2M4Q96R27 311 aa15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 MGLLQ99685 303 aa15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 ACTR6Q9GZN1 396 aa15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 IFNA4P05014 189 aa15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 OR8U9P0C7N5 309 aa15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 KCNC1P48547 511 aa15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 RPS26P62854 115 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 FGL1Q08830 312 aa15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 OR56B2PQ8NGI1 322 aa15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 CYP8B1Q9UNU6 501 aa15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 H3BUI4 141 aa15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 CCL5P13501 91 aa15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 ADRB3P13945 408 aa15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 GSG1LQ6UXU4 331 aa15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 PQLC3Q8N755 202 aa15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 SGTBQ96EQ0 304 aa15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 FAM83CQ9BQN1 747 aa15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 STRADBQ9C0K7 418 aa15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 MTMR11A4FU01 709 aa15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 VEGFDO43915 354 aa15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 THEGLP0DJG4 465 aa15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 CHMP24386 653 aa15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 HNF1BP35680 557 aa15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 GPR4P46093 362 aa15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 OR6C4Q8NGE1 309 aa15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 HDHD5Q9BXW7 423 aa15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 A0A0G2JMP0 313 aa15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 THBS2P35442 1172 aa15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 TMEM205Q6UW68 189 aa15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 DPY19L4Q7Z388 723 aa15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 NLGN4XQ8N0W4 816 aa15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 OR4M2Q8NGB6 313 aa15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 TGM7Q96PF1 710 aa15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 PBDC1Q9BVG4 233 aa15.36■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 FAM227AF5H4B4 570 aa15.35■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 SSX4O60224 188 aa15.35■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 UCHL1P09936 223 aa15.35■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 IRF2P14316 349 aa15.35■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 ACTA2P62736 377 aa15.35■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 ACTG2P63267 376 aa15.35■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 POU4F2Q12837 409 aa15.35■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 C14orf80Q86SX3 495 aa15.35■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 STK35Q8TDR2 534 aa15.35■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa15.35■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 BRI3BPQ8WY22 251 aa15.35■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 LRR1Q96L50 414 aa15.35■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 SIGLEC10Q96LC7 697 aa15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms