RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 ACTR10Q9NZ32 417 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 OR6C2Q9NZP2 312 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 OR52A4PA6NMU1 304 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 SNAP29O95721 258 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ETV4P43268 484 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 SELENOVP59797 346 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 C1orf189Q5VU69 101 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 CNTN4Q8IWV2 1026 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 OR2L2Q8NH16 312 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 DKK3Q9UBP4 350 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 AASSQ9UDR5 926 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 GXYLT2A0PJZ3 443 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 GGT1P19440 569 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 GJA4P35212 333 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 CRISP1P54107 249 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 HTR3EA5X5Y0 456 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 PSKH1P11801 424 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 PTNP21246 168 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 LRIT3Q3SXY7 679 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 TIMM29Q9BSF4 260 aa15.56■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A0J9YY10 115 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 HIDE1A8MVS5 230 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF878C9JN71 531 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 FLRT2O43155 660 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 DNAJB5O75953 348 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 CLIC3O95833 236 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 BNIP3Q12983 259 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF404Q494X3 552 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF559Q9BR84 538 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 MKLN1Q9UL63 735 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 HS3ST2Q9Y278 367 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A1W2PPL8 197 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 VSTM2BA6NLU5 285 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 SOBPA7XYQ1 873 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 H3BSA7 217 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 CCRL2O00421 344 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 PLD2O14939 933 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 SPARCP09486 303 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 NDUFV2P19404 249 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 RGRP47804 291 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ADAM15Q13444 863 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 C6orf141Q5SZD1 244 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 IER5LQ5T953 404 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 GALNT10Q86SR1 603 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 OR13J1Q8NGT2 312 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 TTYH2Q9BSA4 534 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 KCNK12Q9HB15 430 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 NANSQ9NR45 359 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 GON4LQ3T8J9 2241 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 SEC23BQ15437 767 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 DEFB110Q30KQ9 67 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF283Q8N7M2 679 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 HHIPQ96QV1 700 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 LHX3Q9UBR4 397 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 A6NCN8 305 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 DCKP27707 260 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 GJA8P48165 433 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM78AQ5JUQ0 283 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF367Q7RTV3 350 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 CDRT4Q8N9R6 151 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 NTMT1Q9BV86 223 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 MROQ9BYG7 248 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 DMRT3Q9NQL9 472 aa15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A0U1RQS6 177 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 GRXCR2A6NFK2 248 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC22A31A6NKX4 558 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 H0YJX3 145 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 CCNOP22674 350 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 CTSCP53634 463 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM189BP81408 668 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 NPRL3Q12980 569 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 CARTPTQ16568 116 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF765Q7L2R6 523 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 TRIM73Q86UV7 250 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 GAL3ST3Q96A11 431 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 NXPE2Q96DL1 559 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 MS4A4EQ96PG1 132 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 MARCH5Q9NX47 278 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM53CQ9NYF3 392 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 NENFQ9UMX5 172 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF432O94892 652 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ADAP00813 363 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 CELP19835 753 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 CLDN2P57739 230 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-201ENST00000344528 TRAM1Q15629 374 aa15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms