RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A0U1RQS6 177 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 KLHL33A6NCF5 533 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 IGLON5A6NGN9 336 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 MYO1GB0I1T2 1018 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 H3BMQ9 156 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 MT-ND1P03886 318 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 PRNPP04156 253 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 ELFN1P0C7U0 828 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 PRF1P14222 555 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF12P17014 697 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 GPX2P18283 190 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 SDC1P18827 310 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 CRHBPP24387 322 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 MSX1P28360 303 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 IGFALSP35858 605 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 PRLHRP49683 370 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 GZMMP51124 257 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 PFN3P60673 137 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 RPS21P63220 83 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 IL5RAQ01344 420 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 ELP6Q0PNE2 266 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 NAE1Q13564 534 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 NEDD8Q15843 81 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF691Q5VV52 312 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 OR4F3Q6IEY1 312 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 MED27Q6P2C8 311 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 AGTRAPQ6RW13 159 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 TBPL2Q6SJ96 375 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 ASB18Q6ZVZ8 466 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 CBLL1Q75N03 491 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF765Q7L2R6 523 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 DET1Q7L5Y6 550 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 RD3Q7Z3Z2 195 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 CAMKMTQ7Z624 323 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 SLITRK4Q8IW52 837 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 MSRB3Q8IXL7 192 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 C11orf65Q8NCR3 313 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 OR2A12Q8NGT7 310 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM110BQ8TC76 370 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 CPT1CQ8TCG5 803 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 S100ZQ8WXG8 99 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 RORBQ92753 470 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 GLYATL1Q969I3 302 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 MTERF3Q96E29 417 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 RNF31Q96EP0 1072 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 TCTN2Q96GX1 697 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 COG8Q96MW5 612 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 NODALQ96S42 347 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF347Q96SE7 839 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 PCDH12Q9NPG4 1184 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 IL1RAPQ9NPH3 570 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 SERHLQ9NQF3 203 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 PRDM8Q9NQV8 689 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 SIRT5Q9NXA8 310 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 AHSPQ9NZD4 102 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC22A14Q9Y267 594 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 GMPPBQ9Y5P6 360 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 NAV3Q8IVL0 2385 aa6.67□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 PCNX1Q96RV3 2341 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 SH3PXD2BA1X283 911 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIM64BA6NI03 449 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 B4DGG1 531 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 M0QX08 132 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 GNB5O14775 395 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 ADAMDEC1O15204 470 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC22A1O15245 554 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 RAD1O60671 282 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 LEFTY1O75610 366 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 LRATO95237 230 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 KRT75O95678 551 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 CLIC3O95833 236 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 ANGPTL1O95841 491 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 PDGFAP04085 211 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 RPN2P04844 631 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 EPXP11678 715 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 BMP4P12644 408 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 ADRB3P13945 408 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 LHCGRP22888 699 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 ITGB7P26010 798 aa6.66□□□□□ -1.34
SMARCE1-201ENST00000264640 PCSK6P29122 969 aa6.66□□□□□ -1.34
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